More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6066 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  72.97 
 
 		 270 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  69.88 
 
 		 303 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  69.88 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  65.77 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  65.76 
 
 		 278 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  66.15 
 
 		 284 aa  338  7e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  66.67 
 
 		 287 aa  332  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  65.77 
 
 		 286 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  65.37 
 
 		 290 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  65.37 
 
 		 290 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  65.37 
 
 		 290 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  66.28 
 
 		 277 aa  325  7e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  62.31 
 
 		 278 aa  322  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  63.42 
 
 		 264 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  63.02 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  61.45 
 
 		 266 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  62.5 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  56.44 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  60.55 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  59.22 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  59.61 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  59.3 
 
 		 273 aa  301  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  59 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  58.46 
 
 		 274 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  61.57 
 
 		 268 aa  295  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  59.44 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  60.39 
 
 		 261 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  59.06 
 
 		 261 aa  291  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  59.06 
 
 		 261 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  59.61 
 
 		 261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  59.53 
 
 		 286 aa  285  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  59.43 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  54.41 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  53.54 
 
 		 306 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  42.41 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  40.79 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  39.31 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  44.19 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  45.35 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  45.35 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  44.14 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  41.02 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  38.31 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.15 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  36.67 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  36.67 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  38.2 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  37.08 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  40.08 
 
 		 262 aa  159  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  36.22 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  37.2 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  43.16 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  30.68 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  35.02 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  37.26 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  33.72 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  30.15 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  29.07 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  35.8 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  26.85 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  30.88 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  33.6 
 
 		 384 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  23.92 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  25.28 
 
 		 268 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.31 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  33.99 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  30.47 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  28.52 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  28.63 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  34.13 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  24.39 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  29.91 
 
 		 500 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  27.71 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  31.51 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  32.8 
 
 		 336 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  37.25 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  35.04 
 
 		 636 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  27.31 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  29.65 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  34.92 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.96 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.63 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  41.26 
 
 		 479 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  29.09 
 
 		 491 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  36.05 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  28.74 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  41.04 
 
 		 483 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.51 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>