More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1825 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  100 
 
 
505 aa  1007    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  46.75 
 
 
519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  46.4 
 
 
517 aa  448  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  46.42 
 
 
500 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  44.22 
 
 
506 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.53 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 
507 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.78 
 
 
506 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.61 
 
 
507 aa  415  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.61 
 
 
507 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  45.17 
 
 
519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.28 
 
 
503 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.89 
 
 
492 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.68 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.93 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  43.84 
 
 
517 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  44.03 
 
 
517 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.12 
 
 
495 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  44.03 
 
 
517 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  44.06 
 
 
516 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  44.03 
 
 
517 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
497 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.88 
 
 
508 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  41.73 
 
 
502 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
517 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  44.42 
 
 
511 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
504 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 
510 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.37 
 
 
497 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
517 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.44 
 
 
517 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.04 
 
 
506 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  44.02 
 
 
514 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  44.97 
 
 
498 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.52 
 
 
515 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.97 
 
 
519 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  42.43 
 
 
514 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  43.57 
 
 
518 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  43.03 
 
 
500 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  42.01 
 
 
510 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 
517 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 
517 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  45.83 
 
 
507 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  43.19 
 
 
512 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  44.13 
 
 
509 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.8 
 
 
513 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  41.01 
 
 
495 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
527 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  43.25 
 
 
517 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.36 
 
 
520 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.38 
 
 
496 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0843  ABC transporter related  45.88 
 
 
496 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.0750454 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.37 
 
 
514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  42.83 
 
 
511 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.56 
 
 
517 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  43.25 
 
 
517 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
504 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.37 
 
 
514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.12 
 
 
496 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
525 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40.97 
 
 
496 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  43.86 
 
 
506 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  42.54 
 
 
518 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
494 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.69 
 
 
501 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  43.84 
 
 
506 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.6 
 
 
524 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 
516 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.58 
 
 
524 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.44 
 
 
499 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 
501 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.58 
 
 
524 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.78 
 
 
524 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  42.08 
 
 
516 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  43.23 
 
 
503 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.49 
 
 
495 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  41.78 
 
 
501 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
496 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.67 
 
 
495 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  41.62 
 
 
499 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.09 
 
 
514 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  40.96 
 
 
509 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  40.16 
 
 
497 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  40.96 
 
 
520 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  43.23 
 
 
506 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.55 
 
 
501 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.97 
 
 
523 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 
499 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  40.73 
 
 
506 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.72 
 
 
524 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>