More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3088 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  68.36 
 
 		 270 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  68.34 
 
 		 264 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  66.28 
 
 		 303 aa  324  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  67.84 
 
 		 264 aa  324  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  62.31 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  62.87 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  61.72 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  61.48 
 
 		 280 aa  318  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  67.57 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  63.57 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  65.6 
 
 		 276 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  59.92 
 
 		 270 aa  311  7.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  64.66 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  64.06 
 
 		 266 aa  309  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  63.67 
 
 		 262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  63.75 
 
 		 263 aa  308  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  60.23 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  59.3 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  60.78 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  60.78 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  60.77 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  60.78 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  63.04 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  61.63 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  62.11 
 
 		 265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  62.26 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  62.16 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  62.02 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  62.65 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  63.28 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  58.89 
 
 		 274 aa  295  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  62.5 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  59.14 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  58.43 
 
 		 306 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  58.37 
 
 		 277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  44.31 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  41.58 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  45.35 
 
 		 271 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  37.98 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  42.02 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  43.61 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  43.98 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  43.61 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  42.32 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  43.15 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  43.32 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.76 
 
 		 263 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.38 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  36.72 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  36.72 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  42.7 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  41.57 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  39.43 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  35.42 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 		 275 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  32.58 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  33.72 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  26.75 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  34.91 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  35.8 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  27.31 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  34.8 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  28.05 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  35.88 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  33.33 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  25.78 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  27.52 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  35.07 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  37.5 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  31.25 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  39.34 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  38.22 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  24.61 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  36.02 
 
 		 514 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  34.19 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  26.51 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  38.22 
 
 		 636 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  25.79 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.41 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  39.34 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.49 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.39 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  28.91 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  32.95 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  32.4 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.25 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  32.65 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  28.19 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  29.33 
 
 		 499 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  36.74 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2859  ABC transporter related  30.99 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1887  ABC transporter-related protein  36.62 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  36.36 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>