More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1150 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2859  ABC transporter related  44.25 
 
 
283 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  39.52 
 
 
418 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  35.22 
 
 
239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  39.84 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0775  ABC transporter related  37.6 
 
 
243 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  40.54 
 
 
278 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  42.91 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  39.84 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
247 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  40.25 
 
 
251 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  35.2 
 
 
246 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  38.8 
 
 
266 aa  158  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  34.27 
 
 
260 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  41.13 
 
 
296 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.47 
 
 
266 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  35.83 
 
 
258 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  39.02 
 
 
427 aa  156  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  40.77 
 
 
246 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  39.2 
 
 
256 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.76 
 
 
248 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
248 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  41.3 
 
 
271 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  36.25 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  38.15 
 
 
257 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  36.1 
 
 
285 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  37.11 
 
 
266 aa  152  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  34.92 
 
 
256 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.8 
 
 
255 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.51 
 
 
258 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  37.75 
 
 
257 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.35 
 
 
255 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  36.99 
 
 
421 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  34.96 
 
 
251 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.25 
 
 
263 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  38.46 
 
 
262 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  32.28 
 
 
262 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.74 
 
 
256 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  39.27 
 
 
265 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  41.06 
 
 
260 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  36.36 
 
 
248 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
255 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  35.89 
 
 
288 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  34.55 
 
 
266 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  34.63 
 
 
261 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
258 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 
257 aa  148  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  36.44 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.47 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  35.32 
 
 
409 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  37.76 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  36.03 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  35.38 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  35.38 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  31.56 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
255 aa  146  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0295  ABC transporter related  36.91 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.333842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  36.73 
 
 
298 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  36.22 
 
 
257 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
264 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.89 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  35.89 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 
265 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 
269 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  36.44 
 
 
259 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  36.03 
 
 
259 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  36.57 
 
 
280 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  35 
 
 
283 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1167  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
229 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 
254 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  37.7 
 
 
275 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  39.91 
 
 
264 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  35 
 
 
283 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 
254 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  38.46 
 
 
412 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  37.4 
 
 
275 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  29.96 
 
 
236 aa  143  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  31.2 
 
 
259 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
274 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  37.34 
 
 
311 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.73 
 
 
273 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  39.57 
 
 
262 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  37.1 
 
 
292 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  33.47 
 
 
269 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 
254 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.73 
 
 
273 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  41.53 
 
 
297 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.73 
 
 
273 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  33.47 
 
 
263 aa  142  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  32.66 
 
 
258 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  33.47 
 
 
427 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  33.73 
 
 
273 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
296 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.74 
 
 
262 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  37.7 
 
 
275 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  41.53 
 
 
297 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
249 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  35.6 
 
 
248 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>