More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2859 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2859  ABC transporter related  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  44.25 
 
 
272 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  32.67 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2581  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00566513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  30.91 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.58 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  33.45 
 
 
262 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  31.16 
 
 
249 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  34.21 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 
254 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
249 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  33.21 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
259 aa  129  6e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  33.64 
 
 
249 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  32.21 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  31.37 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  32.85 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  39.71 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  33.09 
 
 
243 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  32.5 
 
 
286 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06304  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  30.04 
 
 
261 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  37.23 
 
 
256 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  32.16 
 
 
261 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  35.27 
 
 
249 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  33.73 
 
 
277 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  34.06 
 
 
278 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  31.32 
 
 
256 aa  122  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 
259 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  35.12 
 
 
265 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  29.67 
 
 
264 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 
264 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  32.5 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  34.38 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  34.21 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  27.74 
 
 
427 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 
265 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  30.71 
 
 
254 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  32.03 
 
 
275 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  32.45 
 
 
253 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.46 
 
 
284 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  32.72 
 
 
262 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  32.34 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  32.23 
 
 
259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  32.54 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  33.33 
 
 
251 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  29.79 
 
 
276 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  32.08 
 
 
253 aa  119  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  34.4 
 
 
266 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  31.1 
 
 
275 aa  118  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  32.73 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  33.99 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  31.67 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  28.62 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  31.25 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  28.62 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  33.09 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.1 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  33.99 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0775  ABC transporter related  35.14 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  28.36 
 
 
254 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  32.03 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  30.8 
 
 
455 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  27.9 
 
 
249 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  27.72 
 
 
236 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  35.56 
 
 
266 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  29.84 
 
 
268 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  29.82 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  33.83 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  32.6 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.2 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  30.51 
 
 
427 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  23.36 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0295  ABC transporter related  33.91 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.333842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  35.43 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  29.48 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  30.04 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  31.37 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  35.56 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  28.97 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  28.99 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  34.88 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  30.92 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  27.68 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.68 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  31.54 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  30.92 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  28.62 
 
 
250 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.13 
 
 
263 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  33.21 
 
 
282 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>