More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1856 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  100 
 
 
290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  100 
 
 
290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  100 
 
 
290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  85.04 
 
 
280 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  88.33 
 
 
278 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  83.21 
 
 
287 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  72.06 
 
 
277 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  73.54 
 
 
284 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  68.22 
 
 
270 aa  349  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  65.77 
 
 
273 aa  335  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  62.84 
 
 
291 aa  316  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  62.55 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  60.94 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  60 
 
 
264 aa  305  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  61.57 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  59.92 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  58.43 
 
 
271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  59.77 
 
 
286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  59.2 
 
 
264 aa  299  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  58.04 
 
 
261 aa  295  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  54.96 
 
 
272 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  53.15 
 
 
270 aa  287  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  58.8 
 
 
262 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  56.92 
 
 
266 aa  285  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  58.66 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  55.85 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  58.08 
 
 
261 aa  278  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  55.04 
 
 
274 aa  276  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  55.64 
 
 
286 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  56.86 
 
 
268 aa  272  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  55.82 
 
 
276 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  53.82 
 
 
263 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  54.72 
 
 
306 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  55.29 
 
 
261 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  52.92 
 
 
274 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  51.94 
 
 
261 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
271 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  41.44 
 
 
262 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  41.77 
 
 
275 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
260 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
260 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  43.39 
 
 
272 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  37.91 
 
 
282 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  42.7 
 
 
275 aa  185  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  41.27 
 
 
259 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  41.27 
 
 
259 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  42.06 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 
264 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  41 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  39.67 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  36.12 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.97 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  35.69 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  35.69 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.24 
 
 
263 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
270 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  37.4 
 
 
265 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.69 
 
 
264 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  34.63 
 
 
262 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  35.41 
 
 
272 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  30.86 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  32.42 
 
 
262 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  26.72 
 
 
262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 
263 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  27.6 
 
 
268 aa  118  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  27.34 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  25.1 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  29.35 
 
 
263 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  28.2 
 
 
263 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  34.76 
 
 
393 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  34.22 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  26.61 
 
 
262 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.97 
 
 
277 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  25.1 
 
 
266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  33.05 
 
 
273 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  31.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  31.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 
263 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  31.3 
 
 
265 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  27.63 
 
 
271 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  29.39 
 
 
269 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  31.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  31.82 
 
 
384 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  28.52 
 
 
266 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  31.52 
 
 
269 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.06 
 
 
267 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  28.74 
 
 
418 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  30.22 
 
 
500 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  31.25 
 
 
271 aa  105  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  32.08 
 
 
313 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
278 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  32.94 
 
 
272 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  26.61 
 
 
500 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.44 
 
 
322 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>