More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_721 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  100 
 
 
263 aa  540  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  89.35 
 
 
263 aa  485  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  85.55 
 
 
263 aa  474  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  48.25 
 
 
269 aa  248  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  47.84 
 
 
271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  44.96 
 
 
271 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  44.19 
 
 
262 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  42.97 
 
 
261 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
267 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  41.29 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  36.82 
 
 
272 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  38.25 
 
 
262 aa  188  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 
290 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
266 aa  162  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  34.62 
 
 
263 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  36.08 
 
 
262 aa  158  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.88 
 
 
269 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  35.71 
 
 
265 aa  156  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  36.73 
 
 
336 aa  155  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  32.68 
 
 
270 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  33.33 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  32.02 
 
 
270 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  33.33 
 
 
262 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  32.14 
 
 
262 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  32.27 
 
 
262 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  34.29 
 
 
275 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  31.23 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  29.46 
 
 
268 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  32.94 
 
 
418 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.35 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  31.03 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  31.64 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  31.42 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  29.17 
 
 
270 aa  125  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.43 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  28.8 
 
 
263 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  31.95 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.01 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  30.45 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  27.61 
 
 
266 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  28.63 
 
 
273 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  28.24 
 
 
265 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  28.9 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.32 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  29.66 
 
 
264 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  30.08 
 
 
278 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  28.02 
 
 
268 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.1 
 
 
258 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  31.5 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  27.41 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  28.79 
 
 
268 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  30.89 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  29.06 
 
 
286 aa  115  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  28.68 
 
 
259 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  29.07 
 
 
259 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  29.07 
 
 
259 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  34.06 
 
 
636 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  29.89 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  28.69 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  29.32 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  26.74 
 
 
282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  29 
 
 
479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  30.52 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  28.45 
 
 
620 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  26.94 
 
 
261 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  29 
 
 
479 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  30.61 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  32.1 
 
 
409 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  28.2 
 
 
290 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.31 
 
 
268 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  28.2 
 
 
290 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  31.06 
 
 
307 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  30.2 
 
 
258 aa  112  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  28.2 
 
 
290 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  28.96 
 
 
265 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  33.2 
 
 
252 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  31.13 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  29.96 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  30.3 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  33.33 
 
 
253 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  28.86 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  33.6 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  28.3 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  33.05 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  33.33 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  27.94 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3207  ABC transporter related  32.9 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  34.89 
 
 
250 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  28.41 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.57 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  31.1 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03320  ABC transporter related  30 
 
 
368 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.29 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  32.92 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20330  cell division ATP-binding protein FtsE  30.4 
 
 
344 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  28.46 
 
 
273 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  31.49 
 
 
253 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  27.86 
 
 
280 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>