More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1483 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  100 
 
 
262 aa  523  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  60.92 
 
 
265 aa  325  5e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
263 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
267 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  36.05 
 
 
262 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  35.52 
 
 
270 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
275 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  34.9 
 
 
270 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  38.08 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
263 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  40.93 
 
 
262 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  38.25 
 
 
263 aa  188  9e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  39.04 
 
 
263 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  32.26 
 
 
268 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  39.77 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  37.16 
 
 
271 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  28.91 
 
 
262 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  30.2 
 
 
262 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  29.8 
 
 
262 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  41.5 
 
 
283 aa  168  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  37.05 
 
 
271 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  32.94 
 
 
262 aa  164  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  35.41 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 
290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  35.74 
 
 
336 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  32.78 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.87 
 
 
269 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  33.61 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  32.81 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  30.68 
 
 
270 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  34.8 
 
 
278 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  32.42 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.99 
 
 
263 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  32.41 
 
 
265 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.86 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  32.42 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  32.42 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  32.42 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  34.13 
 
 
273 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  31.47 
 
 
286 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.53 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.62 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  29.55 
 
 
260 aa  119  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  32.41 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  33.06 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  31.25 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  31.3 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.54 
 
 
274 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  34.24 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  32.42 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  30.52 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  35.62 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  30.86 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  32.14 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  36.44 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.17 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.17 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  34.89 
 
 
304 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  34.31 
 
 
303 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.55 
 
 
264 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  31.78 
 
 
276 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  35.17 
 
 
304 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  28.39 
 
 
240 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  35.17 
 
 
304 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.39 
 
 
240 aa  111  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  31.53 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  35.6 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  31.45 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  30.9 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  28.33 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  35.18 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  32.14 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.36 
 
 
240 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
266 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  28.96 
 
 
253 aa  109  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  33.76 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  31.62 
 
 
284 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  34.33 
 
 
373 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  33.76 
 
 
320 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  28.57 
 
 
254 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.92 
 
 
263 aa  109  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  30.87 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  31.54 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 
244 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  26.95 
 
 
260 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  29.71 
 
 
255 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  29.74 
 
 
242 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.97 
 
 
285 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  32.02 
 
 
288 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  28.96 
 
 
253 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 
240 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  32.2 
 
 
251 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  29.71 
 
 
254 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  30.43 
 
 
259 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  33.19 
 
 
317 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  30.6 
 
 
244 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  30.43 
 
 
259 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>