More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0817 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  85.55 
 
 		 263 aa  474  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  86.31 
 
 		 263 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  49.04 
 
 		 275 aa  254  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  48.44 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  44.27 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  43.85 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  43.56 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  37.74 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  38.98 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  38.59 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.07 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  36.86 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  37.45 
 
 		 336 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  34.63 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  32.16 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  33.33 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  32.02 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  33.33 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  32.68 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  30.98 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  31.78 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  35.1 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  30.98 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.4 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  32.06 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  32.06 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.65 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.2 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  31.85 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  29.01 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  32.05 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  29.66 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  29.32 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  31.06 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.75 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.47 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  30 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  30.89 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  32.45 
 
 		 409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  32.03 
 
 		 479 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4006  cell division ATP-binding protein FtsE  31.6 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  28.31 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  30.64 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  28.91 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  29.81 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  28.95 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  31 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  29.3 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  31.42 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  29.92 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  28.41 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  29.3 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  29.67 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  28.69 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  30.38 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3468  ABC transporter-related protein  31.6 
 
 		 479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  31.64 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.6 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  29.18 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  35 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  29.32 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  33.33 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  29.55 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  28.51 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  30.58 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  35.39 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  30.89 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3385  ABC transporter, ATPase subunit  31.6 
 
 		 478 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.238617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  30.74 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  30.23 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  32.26 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  31.75 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  29.44 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  32.67 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  29.32 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  34.58 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1731  cell division ATP-binding protein FtsE  31.88 
 
 		 229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  34.58 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  29.48 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  30.74 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  31.75 
 
 		 562 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3446  ABC transporter related  30.13 
 
 		 620 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.055391  normal  0.816611 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0487  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  30.86 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  28.34 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  30.25 
 
 		 619 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  29.61 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.402679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  29.55 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1407  cell division ATP-binding protein FtsE  32.57 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0924913  normal  0.397087 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  33.02 
 
 		 320 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  30.59 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>