More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1786 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  100 
 
 		 270 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  63.92 
 
 		 265 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  63.24 
 
 		 259 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  62.85 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  62.85 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  58.89 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  53.15 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  53.36 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  47.67 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  44.57 
 
 		 274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  47.89 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  46.83 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  43.13 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  44.74 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  45.04 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  44.94 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  47.29 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  44.27 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  47.2 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  43.89 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  45.11 
 
 		 291 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  44.23 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 266 aa  184  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  44.14 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  44.66 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  39.69 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  45 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  43.7 
 
 		 303 aa  178  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  42.59 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  42.7 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  43.15 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  42.68 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  42.5 
 
 		 287 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  40.52 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  38.22 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  39.68 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  39.68 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  39.68 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  40.49 
 
 		 280 aa  161  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  36.46 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  36.43 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  36.43 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  33.98 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.05 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  33.08 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.86 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  35.5 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  30.5 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  37.36 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  31.82 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  32.95 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  32.82 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  33.97 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  37.4 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  34.11 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  33.07 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  34.3 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  31.44 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  30.61 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  30.65 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  25.38 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  32.54 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  29.57 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  32.52 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.85 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  24.23 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  30.8 
 
 		 494 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  28.28 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  29.43 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1174  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  36.71 
 
 		 488 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3884  ABC transporter-related protein  34.33 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  25.2 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.5 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  34.5 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  26.82 
 
 		 258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  29.17 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  37.08 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.07 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.04 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  31.2 
 
 		 499 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  34.91 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  31.56 
 
 		 315 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>