More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3276 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  100 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  73.8 
 
 		 280 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  73.56 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  72.48 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  72.48 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  72.48 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  73.15 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  71.76 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  66.28 
 
 		 273 aa  341  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  65.4 
 
 		 270 aa  338  5e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  61.78 
 
 		 303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  61.39 
 
 		 291 aa  311  9e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  62.55 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 286 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  58.05 
 
 		 272 aa  301  8.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  56.18 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  58.37 
 
 		 278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  57.09 
 
 		 265 aa  285  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  55.86 
 
 		 264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  54.26 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  58.5 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  57.75 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  57.36 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  56.47 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  54.1 
 
 		 273 aa  278  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  56.32 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  51.5 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  53.99 
 
 		 286 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  55.81 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  54.37 
 
 		 263 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  51.33 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  51.55 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  51.76 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  51.76 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  38.52 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  39.13 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  42.29 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  42.29 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  43.65 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  37.35 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  41.2 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  36.1 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  38.85 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  38.08 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  38.11 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  36.08 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  36.08 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.89 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  39.62 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  36.33 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  31.25 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  35.91 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  33.08 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  31.7 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  27.94 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  28.52 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  26.85 
 
 		 262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  26.07 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  33.2 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  30.96 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  27.62 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  35.25 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  28.96 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  31.54 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  28.28 
 
 		 455 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  31.52 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  31.42 
 
 		 494 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  29.67 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.9 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  26.79 
 
 		 500 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  34.35 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  30.61 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  26.67 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2850  ABC transporter related  31.7 
 
 		 500 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  30.71 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  29.96 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  31.5 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  34.05 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  29.2 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.15 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  34.82 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  26.81 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.07 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  29.39 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  30.89 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  33.33 
 
 		 636 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  25 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  26.56 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  35.16 
 
 		 562 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  27.27 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>