More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1076 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  531  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.77 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  36.29 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.36 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.89 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  36.58 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  35.52 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  36.64 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  33.59 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  37.45 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  33.59 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  36.78 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  35.14 
 
 		 261 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.63 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  33.85 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  35.8 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  32.03 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  33.46 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  31.4 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  37.35 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  34.63 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  30.68 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  33.48 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  35.8 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  31.67 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  34.23 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  32.82 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  32.82 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  35.8 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  36 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  35.18 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  35.18 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  35.18 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  31.35 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  34.62 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  31.73 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  32.94 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  27.27 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.35 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.69 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  35.66 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  30.6 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  32.17 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.63 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  34.13 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  31.87 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  35.68 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  28.17 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  30.91 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  28.79 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  31.54 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  26.28 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  34.47 
 
 		 330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  26.74 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1970  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.63 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  35.94 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  29.55 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  35.29 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  32.97 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  30.92 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  34.98 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  34.25 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  32.92 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  30.56 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  35.58 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  35.92 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  35.14 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  29.6 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  28.74 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  32.43 
 
 		 372 aa  106  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  32.16 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  29.53 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  35.36 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  32.58 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  32.05 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  28.69 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  32.05 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  33.68 
 
 		 409 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  27.76 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>