More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0844 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  45.53 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7254  ABC transporter related  45.11 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497205  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  36.25 
 
 		 280 aa  164  9e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  36.51 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  37.87 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  35.92 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  35.98 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.52 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  36.32 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  36.02 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  33.6 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  35.04 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  34.5 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  34.76 
 
 		 271 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 		 254 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  35.02 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  33.91 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  34.8 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  38.01 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  39.29 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  35.32 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  38.01 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  33.33 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  35.02 
 
 		 288 aa  148  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  37.14 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  37.44 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  35.32 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  34.89 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  33.19 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  35.29 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  32.33 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  35.06 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  38.3 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.94 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  35.27 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  34.6 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  34.17 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  38.82 
 
 		 247 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  35.93 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  34.17 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  38.39 
 
 		 300 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  35.06 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  38.6 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  31.35 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  36.79 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  31.35 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  36.79 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3403  ABC transporter related  34.04 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  33.33 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  33.33 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  33.33 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.21 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  34.74 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 249 aa  141  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  35.04 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  32.77 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  36.79 
 
 		 275 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  32.91 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  37.38 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.23 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  37.1 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  37.38 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  33.62 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  31 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  31.33 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  33.05 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  35.34 
 
 		 298 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  34.63 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  33.06 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  34.85 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 		 237 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  31.97 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  34.21 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  35.59 
 
 		 321 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  35.59 
 
 		 321 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  32.91 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  34.75 
 
 		 326 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  34.65 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>