More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1174 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  100 
 
 		 299 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  97.66 
 
 		 303 aa  540  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  93.17 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  67.28 
 
 		 266 aa  342  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  66.39 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  65.15 
 
 		 287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.64 
 
 		 250 aa  292  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  62.18 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  61.83 
 
 		 252 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  61.34 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  62.66 
 
 		 298 aa  285  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  63.07 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  61.41 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.26 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  62.66 
 
 		 254 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  59.92 
 
 		 246 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  57.79 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  58.92 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  58.44 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  57.26 
 
 		 251 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  56.54 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  55.7 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  56.84 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  55.27 
 
 		 256 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  63.14 
 
 		 258 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  57.14 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  58.37 
 
 		 245 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  53.97 
 
 		 244 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  53.46 
 
 		 241 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  43.75 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  52.78 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  47.46 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  47.22 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  48.39 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 247 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  45.95 
 
 		 232 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  35.34 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 247 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  41.67 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  40.42 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.05 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  39.91 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  42.45 
 
 		 217 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 249 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  41.15 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  38.03 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  39.34 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  41.67 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  41.44 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 		 238 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  37.02 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40.71 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  41.56 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  41.44 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  36.48 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  38.79 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  38.79 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  40.61 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 247 aa  149  8e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  41.4 
 
 		 222 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  33.09 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  41.01 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  37.97 
 
 		 273 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  37.04 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 262 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  40.17 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  42.66 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  36.44 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  35.12 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  38.06 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  36.68 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  39.09 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  38.16 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40 
 
 		 248 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  35.09 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  37.95 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0281  ABC transporter related  36.73 
 
 		 250 aa  142  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00633179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  38.79 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  36.29 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  37.73 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29271  ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  36.68 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>