More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2229 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  63.95 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  63.52 
 
 		 248 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  63.87 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  63.03 
 
 		 249 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  64 
 
 		 251 aa  291  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  61.18 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  61.44 
 
 		 303 aa  275  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.15 
 
 		 250 aa  275  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  56.6 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  60.25 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.92 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  59.58 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  61.02 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  58.05 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  60.59 
 
 		 304 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  61.44 
 
 		 297 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  57.98 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  57.5 
 
 		 298 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  61.44 
 
 		 287 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  57.45 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  59.15 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  56.6 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  57.08 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  57.63 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  54.89 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  57.58 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  54.18 
 
 		 263 aa  238  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  55.96 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  52.51 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  48.44 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  45.45 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  46.29 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  42.92 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  44.91 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  44.93 
 
 		 271 aa  188  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  43.98 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  187  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  39.91 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  45.22 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  44.74 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 247 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  41.23 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  41.67 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  42.61 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  39.56 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  37.72 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 280 aa  169  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.6 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 		 249 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  35.54 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  42.98 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.99 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  36.84 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  38.82 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  39.46 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  40.35 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  41.59 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  37.34 
 
 		 296 aa  158  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  38.43 
 
 		 273 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  36.29 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2142  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  41.15 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  38.33 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.21 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  39.83 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  41.41 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  38.94 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  39.04 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  39.65 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  37.99 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  38.63 
 
 		 289 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  36.8 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  37.55 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 254 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 254 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.46 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  37.18 
 
 		 288 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.47 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  38.43 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  36.82 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  39.66 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  37.12 
 
 		 266 aa  148  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  39.66 
 
 		 297 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  39.39 
 
 		 296 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  38.86 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>