More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3530 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  88.51 
 
 		 247 aa  424  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  63.09 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  66.97 
 
 		 232 aa  291  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  51.69 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  47.56 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  47.53 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  47.3 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  47.35 
 
 		 256 aa  194  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  46.05 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.36 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  45.87 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.65 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  42.73 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  48.39 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  48 
 
 		 245 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  47.47 
 
 		 304 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  43.32 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  48.39 
 
 		 299 aa  178  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  44.75 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  46.02 
 
 		 297 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  45.97 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  45.13 
 
 		 298 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  42.6 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  44.29 
 
 		 247 aa  175  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  49.75 
 
 		 258 aa  174  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  42.41 
 
 		 252 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  41.01 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 244 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  42.79 
 
 		 252 aa  168  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  45.91 
 
 		 265 aa  167  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  44.04 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  42.17 
 
 		 287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  43.63 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  44.89 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  42.16 
 
 		 268 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  43.63 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  43 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  39.61 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  39.9 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  42.51 
 
 		 289 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  35.75 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.55 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  36.2 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  41.92 
 
 		 263 aa  151  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  36.2 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  38.54 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  44.92 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  40.1 
 
 		 296 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  38.61 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  39.61 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  41.84 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  41.33 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  39 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  34.05 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  39.9 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  40.82 
 
 		 298 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  39.13 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.82 
 
 		 273 aa  145  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  40.3 
 
 		 259 aa  144  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  40.65 
 
 		 222 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  38.42 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  40.82 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  38.53 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  36.1 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  37.27 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  38.53 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  39.2 
 
 		 280 aa  143  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  40.31 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  39.71 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  37.75 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  35.61 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.49 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  36.79 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  40.41 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  37.84 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  36.89 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  34.89 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  37.84 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.41 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  40.28 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>