More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5387 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  100 
 
 		 297 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  77.1 
 
 		 287 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  64.5 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  60 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  60 
 
 		 299 aa  311  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  62.55 
 
 		 266 aa  308  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  65.13 
 
 		 249 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  63.56 
 
 		 252 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  63.05 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.18 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  64.41 
 
 		 254 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  63.16 
 
 		 252 aa  295  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  63.45 
 
 		 251 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  61.98 
 
 		 246 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  57.26 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.3 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 		 249 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  56.38 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  58.16 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  58.85 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  58.12 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  57.94 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  58.4 
 
 		 256 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  56.79 
 
 		 247 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  61.8 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  55.98 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  61.02 
 
 		 245 aa  242  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  54.55 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  54.59 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  50.69 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  42.41 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 245 aa  192  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  51.36 
 
 		 265 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  45.25 
 
 		 239 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  46.02 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  45.05 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  44.98 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  44.74 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  43.29 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.12 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.06 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  41.05 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  40.43 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  41.56 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  40.09 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.07 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  38.26 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  41.12 
 
 		 217 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40.69 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  37.07 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  36.75 
 
 		 251 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  36.67 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.22 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  39.83 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  41.15 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 263 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  38.52 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.39 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.39 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.39 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.86 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 		 237 aa  149  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.39 
 
 		 273 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  40.45 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  34.76 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  40.17 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  40.37 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  38.94 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  36.55 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  45.45 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  41.63 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  39.04 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  40.09 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  38.82 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  38.82 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.17 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  35.66 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  34.78 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  35.06 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 		 238 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  34.17 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  40.44 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  36.02 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  36.32 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>