More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0914 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  89.29 
 
 
252 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  79.35 
 
 
252 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  75.4 
 
 
252 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  76.86 
 
 
249 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  78.06 
 
 
254 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.86 
 
 
250 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  67.08 
 
 
246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  64.83 
 
 
287 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  63.45 
 
 
297 aa  294  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  62.61 
 
 
304 aa  289  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  62.18 
 
 
303 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  55.97 
 
 
298 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  62.18 
 
 
299 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  57.02 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  56.61 
 
 
249 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  56.61 
 
 
248 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  58.58 
 
 
247 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  60.68 
 
 
266 aa  274  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  57.02 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  56.07 
 
 
249 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.2 
 
 
265 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  57.74 
 
 
247 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  56.25 
 
 
256 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  59.74 
 
 
258 aa  261  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  52.99 
 
 
270 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  54.58 
 
 
263 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  57.98 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  52.29 
 
 
241 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  51.17 
 
 
265 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 
244 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  40.62 
 
 
235 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  43.75 
 
 
239 aa  184  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
237 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  42.79 
 
 
236 aa  175  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.72 
 
 
247 aa  175  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
247 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  42.06 
 
 
232 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  32.02 
 
 
236 aa  161  9e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
280 aa  160  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
249 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  36.91 
 
 
298 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  39.21 
 
 
247 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.72 
 
 
259 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.89 
 
 
262 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
255 aa  155  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
237 aa  154  9e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.05 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.48 
 
 
256 aa  152  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
258 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
238 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
263 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 
249 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 
249 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 
249 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  38.86 
 
 
268 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  37.77 
 
 
296 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  36.6 
 
 
296 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  38.79 
 
 
257 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
296 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
249 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  36.84 
 
 
263 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
252 aa  148  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  38.16 
 
 
265 aa  148  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  39.11 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  35.5 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  36.36 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  35.78 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  37.32 
 
 
217 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
261 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  38.43 
 
 
274 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  34.78 
 
 
280 aa  145  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  35.9 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  33.77 
 
 
246 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  37.66 
 
 
298 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  36.73 
 
 
299 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  31.14 
 
 
236 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  36.44 
 
 
259 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  38.2 
 
 
297 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  38.2 
 
 
297 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.97 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  38.33 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  35.24 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  37.99 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.73 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  35.65 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  36.36 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  37.23 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  34.35 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.73 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.73 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.73 
 
 
273 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  37.61 
 
 
300 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  37.05 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  38.21 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  34.25 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  35.4 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>