More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1065 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 265 aa  538  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  78.1 
 
 		 249 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  76.37 
 
 		 249 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  72.02 
 
 		 247 aa  347  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  66.67 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  64.88 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  62.86 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  60.58 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  57.83 
 
 		 287 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  60.91 
 
 		 247 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  54.96 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  57.02 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  58.82 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  57.26 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  56.63 
 
 		 252 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  54 
 
 		 270 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  55.56 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  58.3 
 
 		 297 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  54.2 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  56.65 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  55.6 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  54.92 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  55.04 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  53.33 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  55.51 
 
 		 245 aa  251  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  55.9 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  50.61 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  47.87 
 
 		 241 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  48.64 
 
 		 239 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  48.66 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  42.22 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  48.39 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  46.36 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  42.61 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  47 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  43.6 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 236 aa  171  9e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  41.63 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.66 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  39.34 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  38.17 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40.79 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  36.84 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  39.82 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  39.01 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  38.4 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.37 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  37.66 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.11 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  36.96 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  37.19 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.44 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  39.73 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  34.65 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  35.78 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.84 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  35.89 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.05 
 
 		 273 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  36.17 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  35.39 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.61 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  36.84 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.23 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  36.67 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  31.51 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  31.51 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  31.51 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.89 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  36.36 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.89 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.89 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  35.47 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  34.6 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.89 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  35.96 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  32.35 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  36.14 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  38.46 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  35.96 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>