More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3702 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  100 
 
 		 258 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  62.77 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  60.61 
 
 		 254 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  63.2 
 
 		 246 aa  271  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  59.31 
 
 		 249 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  61.47 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  59.74 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  59.74 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  62.76 
 
 		 303 aa  265  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.74 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  61.8 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  63.14 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  63.48 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  56.47 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  60.94 
 
 		 287 aa  261  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  60 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  56.03 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  59.43 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  57.64 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  55.84 
 
 		 251 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.36 
 
 		 265 aa  251  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  55.9 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  54.59 
 
 		 249 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  55.19 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  54.11 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  52.4 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  57.58 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 241 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  55.5 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  49.19 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  47.27 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  40.62 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  49.75 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  49 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  48.79 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 		 245 aa  181  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  42.04 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.72 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  46.82 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.63 
 
 		 249 aa  172  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  39.83 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  40.53 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  49.31 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.72 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  41.22 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  41.59 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  38.04 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.38 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  43.5 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  40.45 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40.17 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  37.96 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  38.7 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  39.84 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  39.3 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  35.93 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  35.34 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.17 
 
 		 273 aa  158  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  36.74 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.58 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  35.68 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  39.67 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  38.03 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  40.72 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.72 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.85 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  33.76 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  36.56 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  36.71 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  38.53 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  37.83 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  38.2 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  35.71 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  38.43 
 
 		 289 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  38.27 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  38.56 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  32.03 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  38.56 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  38.56 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>