More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3129 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  100 
 
 		 266 aa  527  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  70.61 
 
 		 304 aa  348  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  68.03 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  67.28 
 
 		 299 aa  341  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  66.1 
 
 		 287 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  64.29 
 
 		 298 aa  298  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  65.09 
 
 		 297 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  60.26 
 
 		 252 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  60.25 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  56.72 
 
 		 248 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  61.02 
 
 		 252 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  60.68 
 
 		 251 aa  274  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  59.23 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  59.83 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.31 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.92 
 
 		 265 aa  269  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  58.95 
 
 		 254 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  57.32 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  54.66 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  55.19 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  54.27 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  53.09 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  61.57 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  54.08 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  51.05 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  53.81 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  52.92 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  52.29 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  52.91 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  48 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  45.83 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  38.84 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  45.05 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  44.04 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  35.53 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  41.15 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  40.17 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 236 aa  159  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  41.83 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.44 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  38.98 
 
 		 298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  40.17 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  41.59 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.39 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  37.34 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.58 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  38.96 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.96 
 
 		 273 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.24 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.5 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  39.27 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  36.28 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  38.99 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.4 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  37.38 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  38.99 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.55 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  36.96 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  36.32 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  40.71 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  38.5 
 
 		 274 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  35.56 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  39.71 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  38.4 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  39.82 
 
 		 251 aa  142  7e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  37.24 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 254 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.79 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.23 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1310  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  37.96 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  38.05 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  38.05 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.12 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  38.05 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  37.89 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.39 
 
 		 263 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  36.84 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>