More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0621 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  91.63 
 
 		 249 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  78.1 
 
 		 265 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  68.57 
 
 		 251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  67.36 
 
 		 247 aa  322  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  64.46 
 
 		 248 aa  318  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  59.66 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  62.92 
 
 		 247 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  60.42 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  58.68 
 
 		 246 aa  288  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  56.61 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  54.22 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  55.79 
 
 		 249 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  58.23 
 
 		 287 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  55.38 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  58.12 
 
 		 297 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  63.45 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  54.36 
 
 		 254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  54.17 
 
 		 298 aa  268  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  56.54 
 
 		 304 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  56.54 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  56.54 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  54.66 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  52.89 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  52.46 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  55.46 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  48.87 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  49.08 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  45.33 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  47.3 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  48.85 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  45.07 
 
 		 237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  44.7 
 
 		 232 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 		 245 aa  178  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  43.42 
 
 		 268 aa  174  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  41.85 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.53 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.55 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  38.82 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  38.79 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 237 aa  165  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  39.91 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  37.55 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.75 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  35.06 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  40 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  38.43 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  38.28 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  35.78 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  37.18 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.33 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  41.8 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  38.7 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  37.72 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  34.63 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  38.36 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  37.83 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.44 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.52 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  31.88 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  37.56 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  38.53 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  35.43 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  34.13 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.39 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  35.5 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.36 
 
 		 273 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1814  ABC transporter related  34.63 
 
 		 296 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  34.76 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2631  ATP-binding transport protein  34.63 
 
 		 296 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0977377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1704  chelated iron ABC transporter, ATP-binding protein YfeB  34.63 
 
 		 296 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  35.93 
 
 		 296 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  34.88 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  37.13 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.83 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  33.77 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  35.24 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  35.96 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>