More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2633 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 249 aa  506  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  95.14 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  65.98 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.86 
 
 		 265 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  65.56 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  63.64 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  65.42 
 
 		 249 aa  314  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  59.09 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  56.1 
 
 		 270 aa  285  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  58.3 
 
 		 256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  57.02 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  58.44 
 
 		 304 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  56.43 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  57.26 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  55.42 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  63.95 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  58.58 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  54.66 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  56.72 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  57.68 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  57.26 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  55.37 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  52.89 
 
 		 298 aa  268  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  56.17 
 
 		 254 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  55.33 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  56.47 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  51.65 
 
 		 263 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  50.92 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  52.51 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  52.05 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  49.07 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  48.61 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  47.73 
 
 		 265 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  47.56 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  45.78 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  44.02 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  38.46 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.64 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  36.14 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 263 aa  168  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.65 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  37.28 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  38.22 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  39.3 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.39 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  36.48 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  37.89 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  37.72 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  40.09 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  39.3 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  39.01 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  38.53 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  37.23 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  33.77 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.48 
 
 		 273 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  37.5 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  36.96 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.72 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.33 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0602  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.4 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  36.52 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.68 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  37.9 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  38.02 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06281  ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  35.96 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  34.48 
 
 		 298 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06581  ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.86 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06671  ABC transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 		 254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 		 265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  36.44 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  33.77 
 
 		 280 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  36.12 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  32.9 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>