More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0705 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  77.59 
 
 
239 aa  358  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  66.97 
 
 
236 aa  291  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  66.97 
 
 
247 aa  288  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  51.61 
 
 
237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 
249 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  47.51 
 
 
270 aa  201  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  47.27 
 
 
248 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  47.47 
 
 
256 aa  197  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  47.93 
 
 
244 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  46.36 
 
 
247 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  45.45 
 
 
251 aa  191  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 
280 aa  189  4e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.51 
 
 
265 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  45.97 
 
 
217 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  46.08 
 
 
249 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  43.89 
 
 
249 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  44.44 
 
 
247 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  41.82 
 
 
252 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  45.45 
 
 
298 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  49 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
241 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  45.91 
 
 
304 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  43.64 
 
 
297 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  45.98 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  40.91 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  45.98 
 
 
299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  42.27 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  44.44 
 
 
246 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  41.74 
 
 
254 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
251 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  41.28 
 
 
252 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  45.05 
 
 
266 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 
249 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  43.64 
 
 
245 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  44.09 
 
 
263 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  42.65 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  43.26 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  42.65 
 
 
268 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
247 aa  158  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 
255 aa  158  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  41.87 
 
 
248 aa  157  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  44.7 
 
 
265 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  39.71 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.56 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  39.61 
 
 
246 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  39.13 
 
 
256 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 
261 aa  149  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
258 aa  148  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  33.64 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  40.1 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  40.58 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  40.65 
 
 
222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  36.16 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  37.44 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  38.65 
 
 
296 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  36.1 
 
 
251 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
254 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  39.13 
 
 
262 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
249 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  36.32 
 
 
249 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  39.42 
 
 
243 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  34.67 
 
 
252 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  32.89 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  36.61 
 
 
265 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  32.89 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.31 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  36 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 
237 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  36.12 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  37.81 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  39.74 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  36.61 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  37.8 
 
 
246 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  41.27 
 
 
298 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  36.65 
 
 
256 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
259 aa  137  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  37.8 
 
 
246 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
255 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  40.2 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  34.82 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
221 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  39.89 
 
 
275 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 
238 aa  135  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 
252 aa  135  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.25 
 
 
278 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  36.77 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  32.86 
 
 
236 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  35.98 
 
 
255 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  38.36 
 
 
259 aa  135  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  39.36 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  35.71 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>