More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0843 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  86.9 
 
 		 252 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  83.13 
 
 		 249 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  76.61 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  76.98 
 
 		 252 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  76.59 
 
 		 252 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.19 
 
 		 250 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  67.07 
 
 		 246 aa  331  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  64.41 
 
 		 287 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  63.9 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  62.61 
 
 		 303 aa  288  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  62.61 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  57.68 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  57.55 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  60.92 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  53.75 
 
 		 249 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.02 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  55.97 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  58.37 
 
 		 266 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 		 249 aa  274  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  54.92 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  57.61 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  60.61 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  53.91 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  54.51 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  53.62 
 
 		 270 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  57.98 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  53.63 
 
 		 263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  52.75 
 
 		 241 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  49.35 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  50.7 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  42.41 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  40.28 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  42.6 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  42.52 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  37.72 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2601  ABC transporter related  36.68 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  37.5 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  40.19 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  36.48 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.99 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  38.79 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  36.41 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  38.77 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  36.64 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.95 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  40.19 
 
 		 288 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  38.22 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2210  ABC transporter related protein  37 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1918  ABC transporter related  36.52 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0148813  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.9 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  33.48 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  38.26 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  38.57 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  36.68 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  39.11 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  35.34 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  38.07 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  38.67 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  36.68 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  37.66 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  34.78 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  39.72 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  38.86 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  36.61 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  35.62 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  35.62 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.74 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  33.91 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.99 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  37.02 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  34.22 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  37.02 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  33.77 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2915  ABC transporter related  37.38 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  38.21 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>