More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1201 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  100 
 
 		 291 aa  564  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  89.2 
 
 		 303 aa  488  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  70 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  70.16 
 
 		 270 aa  353  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  69.88 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  69.14 
 
 		 264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  63.98 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  63.32 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  64.98 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  65.35 
 
 		 287 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  65.62 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  64.45 
 
 		 261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  62.87 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  64.45 
 
 		 272 aa  318  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  62.79 
 
 		 290 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  62.79 
 
 		 290 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  62.79 
 
 		 290 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  62.5 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  65.23 
 
 		 262 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  65.23 
 
 		 261 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  64.45 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  62.89 
 
 		 284 aa  309  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  63.46 
 
 		 266 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  64.98 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  63.53 
 
 		 264 aa  305  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  64.84 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  64.45 
 
 		 261 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  63.95 
 
 		 286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  63.28 
 
 		 265 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  63.2 
 
 		 263 aa  299  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  61.39 
 
 		 277 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  62.11 
 
 		 261 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  61.65 
 
 		 276 aa  291  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  59.62 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  59.53 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  58.53 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  46.39 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  42.91 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  51.04 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  47.67 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  47.29 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  47.29 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  40.5 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  39.53 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  37.6 
 
 		 260 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  37.6 
 
 		 260 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  43.45 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 260 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  42.13 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  38.91 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  40.08 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.78 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  43.89 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  36.89 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  38.4 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  32.96 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  32.28 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  34.23 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  31.27 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  35.42 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  24.61 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  25.2 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  30.5 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  25.6 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  38.08 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  24.3 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  37.9 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  31.3 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.59 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  26.85 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  32.96 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  34.24 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  30.09 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  27.67 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  33.33 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  35.68 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  29.13 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  36.68 
 
 		 636 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  28.14 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  27.17 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  29.96 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  25.4 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  42.16 
 
 		 479 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0941  ABC transporter related  33.08 
 
 		 562 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.613771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.39 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  28.68 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  31.75 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1736  ABC transporter related  33.97 
 
 		 483 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0510749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  28.81 
 
 		 491 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  34.13 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  36.51 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0295  ABC transporter related  29.57 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.333842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  34.41 
 
 		 250 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>