More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0639 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  100 
 
 
265 aa  517  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  67.98 
 
 
259 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  67.98 
 
 
259 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  67.19 
 
 
259 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  58.59 
 
 
264 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  58.2 
 
 
264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  63.92 
 
 
270 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  61.26 
 
 
264 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  50.57 
 
 
271 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
272 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
261 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  46.12 
 
 
273 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  45.28 
 
 
274 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  44.36 
 
 
272 aa  191  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  44.62 
 
 
261 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  45 
 
 
270 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  47.31 
 
 
306 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  43.02 
 
 
261 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
261 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  46.54 
 
 
268 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  44.91 
 
 
274 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  45.95 
 
 
286 aa  185  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  41.38 
 
 
260 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  43.24 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  45.06 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  43.46 
 
 
264 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  43.51 
 
 
280 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  42.02 
 
 
270 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  43.7 
 
 
291 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  42.31 
 
 
261 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
266 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  41.63 
 
 
263 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  42.97 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  42.69 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  44.11 
 
 
303 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
286 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  37.64 
 
 
275 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  42.91 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  40.93 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  40.93 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  40.93 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  42.8 
 
 
287 aa  172  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  42.8 
 
 
273 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  39.08 
 
 
282 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  39.46 
 
 
262 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
271 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  42.15 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  35.55 
 
 
260 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  35.55 
 
 
260 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
284 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  39.41 
 
 
275 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  35.91 
 
 
265 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  31.91 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  33.97 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.39 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  38.35 
 
 
283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  28.52 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 
276 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  31.03 
 
 
272 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  33.58 
 
 
269 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  29.18 
 
 
270 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  25.39 
 
 
262 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  25 
 
 
262 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  23.11 
 
 
262 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  35.14 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  26.77 
 
 
268 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  32.8 
 
 
269 aa  118  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  31.06 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  34.29 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  32.26 
 
 
265 aa  115  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  34.18 
 
 
263 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.18 
 
 
263 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  33.72 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  32.91 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  30.92 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.07 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  32.22 
 
 
264 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
258 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  32.3 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  29.96 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
568 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  31.47 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  36.2 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  30.12 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  28.4 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  29.27 
 
 
256 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  32.06 
 
 
266 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  30.74 
 
 
269 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  34.9 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  28.79 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0528  ABC transporter related  35.54 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.570048  normal  0.775267 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  27.63 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  29.27 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>