More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1050 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  100 
 
 
510 aa  991    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
504 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4122  ABC transporter related protein  52.15 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.885223  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2215  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
501 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  46.11 
 
 
508 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  45.81 
 
 
505 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 
492 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  45.11 
 
 
508 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
497 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  44.29 
 
 
519 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 
499 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.06 
 
 
513 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40.82 
 
 
496 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
521 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
499 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  40.16 
 
 
499 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.05 
 
 
494 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 
523 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.2 
 
 
506 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.22 
 
 
496 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  44.86 
 
 
498 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  42.65 
 
 
506 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  41.1 
 
 
500 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
494 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2301  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
517 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  43.71 
 
 
528 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  37.37 
 
 
494 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  43.98 
 
 
500 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
528 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
500 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  38.24 
 
 
494 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  39.88 
 
 
501 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  43.91 
 
 
506 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  40.12 
 
 
517 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  39.88 
 
 
496 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  43.94 
 
 
497 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 
501 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.9 
 
 
501 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  36.53 
 
 
496 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.47 
 
 
495 aa  363  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
496 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  37.88 
 
 
507 aa  363  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 
496 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  43.31 
 
 
506 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  43.31 
 
 
506 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
499 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  43.31 
 
 
506 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  42.68 
 
 
514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.51 
 
 
503 aa  363  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 
508 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.93 
 
 
492 aa  362  8e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.35 
 
 
501 aa  362  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.37 
 
 
510 aa  362  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  45.13 
 
 
522 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 
505 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  42.24 
 
 
522 aa  361  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  42.24 
 
 
516 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.16 
 
 
501 aa  360  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0076  ABC transporter related  44.86 
 
 
507 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.13 
 
 
499 aa  359  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.19 
 
 
504 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  39.56 
 
 
504 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  40.7 
 
 
519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  38.73 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  38.17 
 
 
495 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  41.18 
 
 
501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.41 
 
 
524 aa  356  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  42.11 
 
 
516 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  36.89 
 
 
499 aa  356  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  37.88 
 
 
505 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40 
 
 
495 aa  356  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  39.92 
 
 
503 aa  356  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  40.37 
 
 
503 aa  356  6.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  38.2 
 
 
501 aa  355  7.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
496 aa  355  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  36.2 
 
 
500 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  42.51 
 
 
506 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.16 
 
 
514 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  38.88 
 
 
501 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.16 
 
 
514 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  36.78 
 
 
494 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  36.81 
 
 
501 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.16 
 
 
514 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0239  ABC transporter related protein  40.93 
 
 
512 aa  355  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.48 
 
 
501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  42.68 
 
 
511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.61 
 
 
514 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.98 
 
 
512 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 
508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
516 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.37 
 
 
504 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
499 aa  353  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>