More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3521 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2133  ABC transporter related protein  66 
 
 		 511 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0375585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1659  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  66.2 
 
 		 511 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935771 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0858  autoinducer AI-2 ABC transporter ATP binding protein  99.05 
 
 		 527 aa  1066    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4472  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  67.47 
 
 		 511 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3650  ABC transporter related  99.81 
 
 		 527 aa  1074    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3521  autoinducer AI-2 ABC transporter, ATP binding protein  100 
 
 		 527 aa  1075    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4402  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  67.47 
 
 		 511 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2126  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  65.39 
 
 		 511 aa  655    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0051  ABC transporter, ATP-binding, sugar transport  62.82 
 
 		 502 aa  648    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000186076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1595  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  66 
 
 		 511 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4320  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  67.47 
 
 		 511 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2145  ABC transporter related  66 
 
 		 511 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4405  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  67.47 
 
 		 511 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4290  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  67.47 
 
 		 511 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3536  ABC transporter related  63.36 
 
 		 495 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3503  sugar ABC transporter ATPase  46.76 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3149  ABC transporter related  46.96 
 
 		 491 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180816  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1714  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  66.45 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3015  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.03 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0481734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2263  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2716  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2772  ABC transporter related  38.29 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0913343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3017  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2696  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.63 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2975  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.63 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000730474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2979  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2766  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2978  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  39.64 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  40.43 
 
 		 511 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 499 aa  349  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  41.06 
 
 		 509 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  38.63 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  38.78 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  40.71 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.84 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.14 
 
 		 495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  37.85 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 505 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.29 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.17 
 
 		 501 aa  336  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  39.33 
 
 		 499 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  37.67 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.27 
 
 		 514 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.39 
 
 		 524 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.39 
 
 		 524 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.28 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.39 
 
 		 508 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 		 492 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.58 
 
 		 524 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39 
 
 		 506 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.05 
 
 		 514 aa  332  8e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.69 
 
 		 517 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  37.8 
 
 		 499 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.2 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  39.06 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  38.58 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.37 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.72 
 
 		 504 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  37.8 
 
 		 524 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  37.99 
 
 		 524 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  38.11 
 
 		 511 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 		 527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  37.99 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.22 
 
 		 503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  38.26 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  38.43 
 
 		 516 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.49 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.49 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  38.52 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  36.79 
 
 		 503 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 494 aa  327  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  38.89 
 
 		 499 aa  326  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.77 
 
 		 523 aa  326  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.61 
 
 		 505 aa  326  8.000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  39.25 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  37.06 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  37.01 
 
 		 518 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  38.64 
 
 		 525 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.74 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  37.92 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  38.24 
 
 		 513 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  38.93 
 
 		 521 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  36.84 
 
 		 514 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.99 
 
 		 501 aa  323  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  36.45 
 
 		 506 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  37.92 
 
 		 498 aa  322  9.000000000000001e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  37.16 
 
 		 513 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.75 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  38.59 
 
 		 513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  39 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  38.21 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 		 510 aa  321  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.83 
 
 		 512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  38.59 
 
 		 513 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  38.91 
 
 		 513 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 498 aa  320  6e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>