More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0405 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0405  ABC transporter related  100 
 
 		 510 aa  1014    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0519  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  41.5 
 
 		 498 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4830  ABC transporter related  42.66 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2338  ABC transporter-like  42.34 
 
 		 518 aa  363  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5888  ABC transporter related  42.97 
 
 		 518 aa  359  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.342287  normal  0.513362 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.51 
 
 		 493 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1258  ABC transporter related  41.34 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6574  ABC transporter related  41.34 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6179  ABC transporter related  41.34 
 
 		 520 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6562  ABC transporter related  39.62 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal  0.460133 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6147  ABC transporter related  39.33 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0846704  hitchhiker  0.00350448 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  34.48 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  38.16 
 
 		 537 aa  303  6.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  38.79 
 
 		 523 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  34.96 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  36.66 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  35.41 
 
 		 506 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 		 540 aa  299  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  36.14 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.7 
 
 		 513 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  37.45 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  35.35 
 
 		 518 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  33.33 
 
 		 494 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  35.8 
 
 		 503 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  33.96 
 
 		 492 aa  293  5e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  35.84 
 
 		 522 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 		 511 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  35.39 
 
 		 512 aa  292  8e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  36.78 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  36.14 
 
 		 861 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  35.47 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  36.06 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 494 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 		 503 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1662  ABC transporter related  35.08 
 
 		 503 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0101569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 		 494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  35.53 
 
 		 502 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  33.68 
 
 		 496 aa  290  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 505 aa  290  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 494 aa  290  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 504 aa  289  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  33.87 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  37.52 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  35.98 
 
 		 512 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  33.8 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  35.98 
 
 		 512 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  33.81 
 
 		 496 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  32.87 
 
 		 509 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  35.09 
 
 		 505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  36.15 
 
 		 505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  38.09 
 
 		 521 aa  287  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.76 
 
 		 511 aa  287  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  32.87 
 
 		 520 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  38 
 
 		 518 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  33 
 
 		 499 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 494 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  37.6 
 
 		 522 aa  286  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 504 aa  286  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  35.39 
 
 		 514 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  34.96 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  36.69 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.33 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  38.6 
 
 		 526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 494 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  36.51 
 
 		 517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  32.46 
 
 		 496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  36.8 
 
 		 517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  35.69 
 
 		 512 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  36.8 
 
 		 517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  35.66 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  36.83 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  34.21 
 
 		 512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.71 
 
 		 517 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  38.54 
 
 		 505 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  36.02 
 
 		 511 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  33.4 
 
 		 492 aa  282  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  36.36 
 
 		 506 aa  282  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 		 511 aa  282  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 494 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.12 
 
 		 501 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  37.8 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1534  ABC transporter related  37.96 
 
 		 527 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0657027  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  36.51 
 
 		 517 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  36.51 
 
 		 517 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  39.29 
 
 		 537 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  36.51 
 
 		 517 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  35.7 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  37.37 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  37.06 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  36.86 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  36.07 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>