More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4830 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009672  Oant_4830  ABC transporter related  100 
 
 
504 aa  1002    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5888  ABC transporter related  84.69 
 
 
518 aa  828    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.342287  normal  0.513362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0519  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  55.31 
 
 
498 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2338  ABC transporter-like  45.27 
 
 
518 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.51 
 
 
493 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1258  ABC transporter related  45.7 
 
 
520 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6574  ABC transporter related  45.7 
 
 
520 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108147  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6179  ABC transporter related  46.31 
 
 
520 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.230595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0405  ABC transporter related  42.66 
 
 
510 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6562  ABC transporter related  43.82 
 
 
494 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal  0.460133 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6147  ABC transporter related  43.61 
 
 
493 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0846704  hitchhiker  0.00350448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  37.3 
 
 
519 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  37.83 
 
 
506 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  34.73 
 
 
497 aa  310  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  34.61 
 
 
495 aa  303  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  37.2 
 
 
861 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  34.29 
 
 
498 aa  297  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
501 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  36.57 
 
 
511 aa  296  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  34.92 
 
 
499 aa  296  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  38.17 
 
 
503 aa  295  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  34.54 
 
 
506 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 
507 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  35.73 
 
 
497 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 
507 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  37.2 
 
 
513 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  35.42 
 
 
505 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
505 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  34.49 
 
 
516 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  33.13 
 
 
494 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  37.27 
 
 
503 aa  291  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  35.32 
 
 
504 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  35.57 
 
 
512 aa  290  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  35.37 
 
 
511 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  37.32 
 
 
506 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  33.67 
 
 
503 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  34.93 
 
 
501 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 
501 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.08 
 
 
506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.13 
 
 
495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  35.2 
 
 
500 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  34.58 
 
 
506 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  34.9 
 
 
492 aa  286  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  35.38 
 
 
544 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  37.35 
 
 
504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  37.35 
 
 
504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  37.35 
 
 
504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  32.66 
 
 
501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  35.16 
 
 
506 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  34.66 
 
 
512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  36.36 
 
 
513 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  36.17 
 
 
497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  34.46 
 
 
512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  34.46 
 
 
512 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  33.54 
 
 
501 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.43 
 
 
507 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 
501 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  37.03 
 
 
504 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  35.71 
 
 
503 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  35.57 
 
 
519 aa  283  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  31.13 
 
 
513 aa  282  8.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  37.97 
 
 
537 aa  282  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  36.74 
 
 
514 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  33.67 
 
 
507 aa  282  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
505 aa  282  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  37.03 
 
 
504 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
508 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  31.16 
 
 
509 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 
508 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  37.15 
 
 
529 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  36.47 
 
 
521 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  31.99 
 
 
498 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  37.4 
 
 
494 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2078  ABC transporter related  36.48 
 
 
503 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  34.15 
 
 
503 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  35.15 
 
 
500 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  33.67 
 
 
507 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  32.24 
 
 
515 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  35.42 
 
 
503 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
507 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  34.46 
 
 
512 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  35.06 
 
 
512 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 
513 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  36.51 
 
 
514 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  33.47 
 
 
509 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  34.26 
 
 
514 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  35.45 
 
 
514 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  35.45 
 
 
514 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.76 
 
 
503 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  35.07 
 
 
507 aa  279  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  32.43 
 
 
500 aa  279  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  36.12 
 
 
511 aa  279  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  33.82 
 
 
494 aa  279  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  34.5 
 
 
518 aa  279  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  35.54 
 
 
525 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.26 
 
 
525 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  35.54 
 
 
525 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4228  ABC transporter-related protein  37.2 
 
 
512 aa  279  9e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  34.79 
 
 
516 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>