More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6562 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6562  ABC transporter related  100 
 
 		 494 aa  959    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal  0.460133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  69.54 
 
 		 493 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6147  ABC transporter related  90.08 
 
 		 493 aa  840    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0846704  hitchhiker  0.00350448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1258  ABC transporter related  51.24 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6574  ABC transporter related  51.24 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6179  ABC transporter related  51.04 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230595 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4830  ABC transporter related  43.82 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0519  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  43.8 
 
 		 498 aa  356  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2338  ABC transporter-like  46.01 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5888  ABC transporter related  42.65 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.342287  normal  0.513362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0405  ABC transporter related  40.38 
 
 		 510 aa  329  9e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.38 
 
 		 497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  32.26 
 
 		 498 aa  297  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  37.89 
 
 		 500 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  35.07 
 
 		 503 aa  290  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  33.96 
 
 		 496 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  34.39 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  37.76 
 
 		 495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  34.45 
 
 		 496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  35.36 
 
 		 495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  34.39 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  34.24 
 
 		 515 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  37.98 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  34.17 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.17 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.55 
 
 		 512 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 		 494 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  37.55 
 
 		 512 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 		 494 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 		 494 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  37.16 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  38.11 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  37.53 
 
 		 507 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  37.53 
 
 		 507 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.53 
 
 		 507 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  31.92 
 
 		 493 aa  276  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  33.47 
 
 		 494 aa  276  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 		 507 aa  276  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.89 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  37.32 
 
 		 492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  32.29 
 
 		 499 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 		 523 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  34.51 
 
 		 502 aa  273  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  33.47 
 
 		 500 aa  272  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  37.11 
 
 		 492 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  37.61 
 
 		 517 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  34.32 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.7 
 
 		 522 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  37.18 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  35.67 
 
 		 504 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  35.91 
 
 		 517 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  36.69 
 
 		 519 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  35.85 
 
 		 512 aa  270  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 		 500 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  34.1 
 
 		 492 aa  269  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  33.26 
 
 		 495 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 495 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  36.19 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  33.95 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  33.05 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  38.7 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.06 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  36.16 
 
 		 525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  30.61 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  38.03 
 
 		 522 aa  266  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  36.46 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  31.65 
 
 		 501 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.44 
 
 		 517 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 		 507 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  35.79 
 
 		 513 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  32.85 
 
 		 520 aa  266  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  33.82 
 
 		 500 aa  266  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  35.37 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3321  ABC transporter related  38.75 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  37.66 
 
 		 507 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  37.86 
 
 		 519 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6503  xylose transporter ATP-binding subunit  36.15 
 
 		 519 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399148  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6737  xylose transporter ATP-binding subunit  36.15 
 
 		 519 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.020966  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  35.21 
 
 		 511 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  37.74 
 
 		 516 aa  263  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  32.92 
 
 		 506 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  33.75 
 
 		 502 aa  262  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 		 501 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>