More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5161 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  100 
 
 		 493 aa  975    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6147  ABC transporter related  67.83 
 
 		 493 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0846704  hitchhiker  0.00350448 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6562  ABC transporter related  69.54 
 
 		 494 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal  0.460133 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6179  ABC transporter related  51.02 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1258  ABC transporter related  50.61 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6574  ABC transporter related  50.61 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2338  ABC transporter-like  47.13 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4830  ABC transporter related  45.51 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5888  ABC transporter related  45.86 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.342287  normal  0.513362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0405  ABC transporter related  41.51 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0519  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  42.25 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  33.47 
 
 		 498 aa  320  5e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 497 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  37.57 
 
 		 521 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  38.08 
 
 		 495 aa  300  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  34.37 
 
 		 494 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.83 
 
 		 512 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  39.83 
 
 		 512 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  36.16 
 
 		 500 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 504 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  38.51 
 
 		 502 aa  286  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  32.77 
 
 		 496 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.19 
 
 		 517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  37.53 
 
 		 499 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 		 494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  34.73 
 
 		 515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  38.82 
 
 		 523 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  33.97 
 
 		 492 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 		 494 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 		 494 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 		 494 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  34.67 
 
 		 505 aa  282  9e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  36.67 
 
 		 503 aa  282  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 		 494 aa  282  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  36.84 
 
 		 510 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  32.99 
 
 		 499 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  31.6 
 
 		 496 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  37.42 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  31.92 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  32.35 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 505 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.08 
 
 		 516 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  36.98 
 
 		 506 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 		 540 aa  279  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  36.67 
 
 		 509 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  37.53 
 
 		 501 aa  279  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 		 494 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.48 
 
 		 507 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  36.75 
 
 		 503 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  35.16 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  34.92 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 		 494 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  37.53 
 
 		 502 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  37.61 
 
 		 502 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  35.83 
 
 		 517 aa  277  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  36.95 
 
 		 513 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  34.6 
 
 		 861 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  33.61 
 
 		 492 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  34.61 
 
 		 504 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  35.34 
 
 		 500 aa  276  9e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  32.57 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  34.87 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 		 523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 		 523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  36.34 
 
 		 503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  34.8 
 
 		 508 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  31.39 
 
 		 504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 		 523 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  34.85 
 
 		 504 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  36.38 
 
 		 519 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6816  ABC transporter related  38.25 
 
 		 512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 		 506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 516 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  35.14 
 
 		 515 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  33.83 
 
 		 495 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  37.12 
 
 		 519 aa  273  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 525 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2810  ABC transporter related  36.42 
 
 		 513 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  33.61 
 
 		 500 aa  272  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  34.1 
 
 		 501 aa  272  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  35.91 
 
 		 492 aa  272  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  36.42 
 
 		 502 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  36.23 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2783  ABC transporter related  36.48 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  31.45 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2827  ABC transporter related  36.48 
 
 		 513 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877357  normal  0.0187049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  37.11 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.05 
 
 		 522 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4075  xylose transporter ATP-binding subunit  36.03 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.818661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  36.7 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  36.31 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  34.73 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4187  xylose transporter ATP-binding subunit  36.03 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.300713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.45 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>