More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0519 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0519  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  100 
 
 		 498 aa  996    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4830  ABC transporter related  55.31 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5888  ABC transporter related  57 
 
 		 518 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.342287  normal  0.513362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2338  ABC transporter-like  43.3 
 
 		 518 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0405  ABC transporter related  41.5 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42.25 
 
 		 493 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6147  ABC transporter related  44.23 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0846704  hitchhiker  0.00350448 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6179  ABC transporter related  42.51 
 
 		 520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1258  ABC transporter related  41.8 
 
 		 520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6574  ABC transporter related  41.8 
 
 		 520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6562  ABC transporter related  43.8 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal  0.460133 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  34.24 
 
 		 498 aa  333  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 		 511 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2810  ABC transporter related  39.11 
 
 		 513 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2783  ABC transporter related  38.9 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2827  ABC transporter related  38.9 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877357  normal  0.0187049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 		 507 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  33.95 
 
 		 499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  38.66 
 
 		 503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  36.42 
 
 		 519 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 		 507 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  36.33 
 
 		 506 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.15 
 
 		 496 aa  296  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 497 aa  296  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  33.97 
 
 		 497 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.18 
 
 		 510 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  36.18 
 
 		 510 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  36.18 
 
 		 510 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 		 510 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  33.06 
 
 		 515 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  37.98 
 
 		 514 aa  292  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  34.81 
 
 		 519 aa  292  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  33.82 
 
 		 494 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  34.16 
 
 		 493 aa  290  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  35 
 
 		 506 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  33.4 
 
 		 503 aa  289  7e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  34.48 
 
 		 506 aa  289  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4553  D-allose transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 510 aa  289  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4140  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.42 
 
 		 514 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  33.93 
 
 		 506 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  36.34 
 
 		 507 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  35.64 
 
 		 526 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  35.36 
 
 		 861 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.55 
 
 		 500 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  36.55 
 
 		 500 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  36.63 
 
 		 513 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  35.77 
 
 		 501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  35.64 
 
 		 495 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  34.29 
 
 		 492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  35.98 
 
 		 500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  35.98 
 
 		 500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  37.29 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  36.38 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4218  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.42 
 
 		 520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  0.845406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  32.63 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  34.02 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.29 
 
 		 499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.34 
 
 		 500 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.34 
 
 		 500 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 504 aa  283  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 		 507 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  34.25 
 
 		 495 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.34 
 
 		 500 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  35.54 
 
 		 503 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  36.38 
 
 		 503 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  35.29 
 
 		 503 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  35.57 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.58 
 
 		 506 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  34.58 
 
 		 506 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  34.47 
 
 		 525 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  35.83 
 
 		 537 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 515 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 515 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 500 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 515 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.61 
 
 		 522 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 506 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  36.17 
 
 		 513 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  34.01 
 
 		 499 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  34.52 
 
 		 501 aa  280  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  34.94 
 
 		 508 aa  280  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  31.95 
 
 		 509 aa  279  7e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 507 aa  279  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.54 
 
 		 492 aa  279  9e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  35.56 
 
 		 517 aa  279  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 		 506 aa  279  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.94 
 
 		 506 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  33.67 
 
 		 507 aa  279  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  33.75 
 
 		 506 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  33.75 
 
 		 506 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>