More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4553 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  99.22 
 
 		 510 aa  1044    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  99.22 
 
 		 510 aa  1044    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4553  D-allose transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 510 aa  1051    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  99.22 
 
 		 510 aa  1044    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  99.22 
 
 		 510 aa  1044    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  43.5 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.31 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 		 512 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.57 
 
 		 496 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.75 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.33 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.92 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.14 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.33 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.51 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.05 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.47 
 
 		 496 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.2 
 
 		 494 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.48 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.03 
 
 		 517 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.19 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.66 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.28 
 
 		 513 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  42.57 
 
 		 518 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.78 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.57 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  41.73 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  41.72 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.85 
 
 		 501 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.3 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  41.06 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  42.46 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.3 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.11 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.3 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 		 499 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.58 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.24 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.71 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  42.28 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.46 
 
 		 524 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  42.71 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.71 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.54 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  41.98 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  41.53 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.87 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  41.5 
 
 		 508 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  40.43 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 		 527 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.26 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  42.72 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.57 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.13 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.39 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  40.31 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  42.01 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  40.79 
 
 		 495 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.2 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.64 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.32 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.7 
 
 		 524 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.13 
 
 		 508 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  41.04 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  41.73 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.54 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.24 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  41.32 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.22 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  41.83 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  41.45 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  40.67 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.26 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.64 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>