More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03959 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  100 
 
 		 510 aa  1050    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  100 
 
 		 510 aa  1050    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 510 aa  1050    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1050    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4553  D-allose transporter ATP-binding protein  99.22 
 
 		 510 aa  1044    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 513 aa  510  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  43.9 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.5 
 
 		 501 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 494 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 494 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 494 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 		 494 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.14 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.73 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  42.12 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.73 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.53 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.6 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.68 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.87 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.44 
 
 		 508 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.71 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.67 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.22 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.19 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.37 
 
 		 496 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.06 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  42.77 
 
 		 518 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.18 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 		 501 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.77 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.3 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  41.26 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.3 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  41.73 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  42.86 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  41.72 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.04 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.35 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.77 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.66 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.5 
 
 		 524 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.11 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.11 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.5 
 
 		 524 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.11 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  42.08 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.26 
 
 		 495 aa  392  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.5 
 
 		 524 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.74 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.11 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  42.21 
 
 		 494 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.12 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 		 527 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.32 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  41.73 
 
 		 506 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  41.5 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.6 
 
 		 524 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.66 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  40.51 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.46 
 
 		 494 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  42.21 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  40.83 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.43 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  41.52 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.84 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.84 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.35 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.84 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  41.54 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  41.65 
 
 		 521 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  40.32 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.84 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.76 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.91 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.43 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.4 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  42.03 
 
 		 528 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.84 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.9 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.73 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.84 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  40.87 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.33 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  42.57 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>