More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2783 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1459  ABC transporter related  69.78 
 
 		 512 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2783  ABC transporter related  100 
 
 		 513 aa  1023    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2827  ABC transporter related  100 
 
 		 513 aa  1023    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877357  normal  0.0187049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2810  ABC transporter related  99.03 
 
 		 513 aa  1013    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.56 
 
 		 517 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 497 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  42.02 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.94 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  43.15 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 525 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  43.55 
 
 		 525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.05 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.06 
 
 		 495 aa  405  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  43.33 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  45.49 
 
 		 519 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.3 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.76 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  37.8 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  44.51 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  43.78 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  43.95 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  43.95 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.22 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  43.95 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.5 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  43.55 
 
 		 524 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.36 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  43.75 
 
 		 524 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  43.38 
 
 		 513 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  42.47 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 		 527 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  41.39 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.86 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  39.25 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.27 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.67 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  42.27 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  41.94 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  41.94 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.55 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.2 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  40.08 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  42.27 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  42.06 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  41.09 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  42.27 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  40.29 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  41.94 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  42.27 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  42.71 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.18 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  40.27 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  39.21 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.47 
 
 		 516 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  42.17 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  41.94 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2216  galactoside ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  39.49 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.61 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.07 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 523 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  42.89 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.07 
 
 		 511 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.97 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 523 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.68 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  42.89 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.81 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 523 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.41 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.2 
 
 		 496 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.65 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  42.05 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  42.8 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.37 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>