More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4197 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  72.6 
 
 		 539 aa  687    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 521 aa  1023    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  71.8 
 
 		 555 aa  741    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  57.31 
 
 		 537 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  58.03 
 
 		 536 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  55.26 
 
 		 532 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  56.7 
 
 		 526 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  55.38 
 
 		 517 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  56.29 
 
 		 532 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  55.38 
 
 		 517 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  56.32 
 
 		 526 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  55.78 
 
 		 517 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 		 524 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  54.67 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  54.18 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  57.97 
 
 		 515 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  54.67 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  57.06 
 
 		 537 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  56.35 
 
 		 523 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  53.98 
 
 		 517 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.79 
 
 		 537 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  57.58 
 
 		 537 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  57.58 
 
 		 537 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  57.58 
 
 		 537 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  57.06 
 
 		 537 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  57.38 
 
 		 534 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  56.63 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  58.15 
 
 		 548 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  58.15 
 
 		 523 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  57.95 
 
 		 523 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  56.26 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  45.89 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  42.28 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.87 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.66 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.69 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  44.62 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.25 
 
 		 495 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.48 
 
 		 519 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.68 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  39.8 
 
 		 492 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  42.18 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 492 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.17 
 
 		 497 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.89 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  43.48 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.33 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.09 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  41.5 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  43.95 
 
 		 861 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.29 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  43.29 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  42.4 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.29 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.62 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  43.82 
 
 		 500 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.29 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 497 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.4 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  42.28 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.14 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  42.89 
 
 		 506 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.64 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.83 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  40.92 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 		 512 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  40.66 
 
 		 537 aa  360  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.06 
 
 		 504 aa  360  4e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 499 aa  359  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  37.08 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.75 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  39.56 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  39.84 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.63 
 
 		 512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  41.75 
 
 		 512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38.25 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.85 
 
 		 499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  41.8 
 
 		 511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  41.75 
 
 		 512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.64 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.64 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 		 516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.64 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.17 
 
 		 503 aa  357  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42 
 
 		 508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.85 
 
 		 516 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  40.63 
 
 		 507 aa  356  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>