More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2474 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  73.43 
 
 
532 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  69.55 
 
 
524 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  69.4 
 
 
517 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  77.86 
 
 
534 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  69 
 
 
517 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  76.79 
 
 
537 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  95.72 
 
 
548 aa  931    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  69.37 
 
 
517 aa  693    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  70.38 
 
 
510 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  77.45 
 
 
537 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
515 aa  1004    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  75.2 
 
 
532 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  74.51 
 
 
536 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  74.36 
 
 
537 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  69.8 
 
 
517 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  78.4 
 
 
537 aa  745    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  77.18 
 
 
537 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  78.19 
 
 
537 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  74.56 
 
 
520 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  71.37 
 
 
510 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  77.18 
 
 
537 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  95.72 
 
 
523 aa  931    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  95.91 
 
 
523 aa  933    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  69.55 
 
 
517 aa  683    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  69.94 
 
 
517 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  61.66 
 
 
526 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  62.01 
 
 
526 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
523 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  57.97 
 
 
521 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  56.18 
 
 
539 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  51.54 
 
 
555 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  48.07 
 
 
514 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  48.07 
 
 
514 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  43.93 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.86 
 
 
514 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.25 
 
 
513 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.86 
 
 
516 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.19 
 
 
505 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  46.17 
 
 
495 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.67 
 
 
514 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.77 
 
 
497 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.97 
 
 
515 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.84 
 
 
495 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.9 
 
 
520 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 
512 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.73 
 
 
511 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.51 
 
 
517 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.71 
 
 
513 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.66 
 
 
514 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.12 
 
 
496 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.69 
 
 
512 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.07 
 
 
499 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.69 
 
 
512 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 
508 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.51 
 
 
512 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
497 aa  378  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42.16 
 
 
524 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.06 
 
 
513 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.76 
 
 
540 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  45.82 
 
 
508 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  43.87 
 
 
519 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.5 
 
 
494 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  45.16 
 
 
509 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
525 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0768  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.14 
 
 
496 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000105666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  42.49 
 
 
513 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 
508 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  45.47 
 
 
507 aa  365  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 
496 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  39.88 
 
 
492 aa  363  3e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  42.34 
 
 
511 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 
507 aa  362  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.38 
 
 
504 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  42.38 
 
 
504 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  45.89 
 
 
504 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 
504 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 
504 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 
504 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 
504 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 
504 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  42.38 
 
 
504 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  41.3 
 
 
500 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 
509 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 
522 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 
507 aa  360  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 
504 aa  361  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.61 
 
 
503 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.84 
 
 
519 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 
515 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.61 
 
 
501 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.93 
 
 
506 aa  361  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  42.83 
 
 
492 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  43.26 
 
 
502 aa  360  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>