More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2132 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  68.77 
 
 		 539 aa  698    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  72.54 
 
 		 521 aa  748    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  100 
 
 		 555 aa  1091    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  51.82 
 
 		 532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  52.01 
 
 		 517 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  51.64 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  53.21 
 
 		 537 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  52.01 
 
 		 524 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  51.47 
 
 		 517 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  50.55 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  53.4 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  53.4 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  53.58 
 
 		 537 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  52.54 
 
 		 537 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  50.83 
 
 		 520 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.38 
 
 		 536 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  49.08 
 
 		 517 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.77 
 
 		 537 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  50.18 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  52.01 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  50.55 
 
 		 517 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  52.66 
 
 		 523 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  49.72 
 
 		 517 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  51.72 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  51.51 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  51.17 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 		 548 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  50.83 
 
 		 510 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 		 523 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  51.84 
 
 		 523 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  50.37 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  42.57 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.85 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  39.89 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  40.37 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.7 
 
 		 517 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 497 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.63 
 
 		 520 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.54 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.86 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.69 
 
 		 492 aa  361  2e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.03 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  40.74 
 
 		 519 aa  359  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  40.59 
 
 		 512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  35.39 
 
 		 506 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 540 aa  355  7.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  40.95 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  40.59 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.07 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.96 
 
 		 515 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.14 
 
 		 525 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  39.82 
 
 		 514 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  39.82 
 
 		 514 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  39.7 
 
 		 509 aa  352  8e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 508 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.67 
 
 		 522 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36.97 
 
 		 503 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  39.63 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 		 512 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 492 aa  349  7e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.93 
 
 		 513 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  40.6 
 
 		 517 aa  349  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 		 515 aa  349  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  38.17 
 
 		 511 aa  349  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.78 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.33 
 
 		 514 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.11 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.68 
 
 		 513 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  37.57 
 
 		 501 aa  347  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  39.78 
 
 		 506 aa  346  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  37.71 
 
 		 499 aa  345  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 499 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  36.55 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  36.31 
 
 		 496 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  39.63 
 
 		 861 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 		 494 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 		 494 aa  343  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  35.74 
 
 		 496 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 		 497 aa  342  9e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.96 
 
 		 508 aa  342  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.78 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  38.66 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2599  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.19 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  38.6 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 		 520 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.59 
 
 		 507 aa  340  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>