More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1868 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  72.8 
 
 		 532 aa  730    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  69.37 
 
 		 510 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  70.06 
 
 		 524 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  69.63 
 
 		 517 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  68.05 
 
 		 517 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  67.65 
 
 		 517 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  76.21 
 
 		 534 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  99.81 
 
 		 548 aa  1015    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  69.43 
 
 		 517 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  74.26 
 
 		 537 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  75.96 
 
 		 537 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  74.76 
 
 		 537 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  95.91 
 
 		 515 aa  961    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  74.52 
 
 		 532 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  73.08 
 
 		 536 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  75.14 
 
 		 537 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  70.06 
 
 		 517 aa  680    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  75.81 
 
 		 537 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  70.75 
 
 		 510 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  74.65 
 
 		 520 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  75.14 
 
 		 537 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  99.81 
 
 		 523 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  76.01 
 
 		 537 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  69.76 
 
 		 517 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  62.01 
 
 		 526 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  61.81 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 		 523 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  56.29 
 
 		 539 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  58.15 
 
 		 521 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  51.65 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.66 
 
 		 495 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  46.49 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  48.07 
 
 		 516 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.68 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  46.18 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.68 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.47 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  43.23 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 511 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.8 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  43.78 
 
 		 505 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.63 
 
 		 513 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.92 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.9 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.87 
 
 		 512 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  47.27 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.15 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.87 
 
 		 512 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.26 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.96 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.33 
 
 		 514 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.92 
 
 		 496 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.28 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  45 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0768  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000105666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 504 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  40.5 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  42.6 
 
 		 513 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.29 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.52 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.82 
 
 		 525 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.02 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  43.49 
 
 		 519 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  45.28 
 
 		 508 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  43.45 
 
 		 492 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  39.71 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.94 
 
 		 495 aa  362  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  40.63 
 
 		 505 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 528 aa  360  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  43.09 
 
 		 501 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 		 508 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  41.3 
 
 		 500 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  42.54 
 
 		 511 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  45.06 
 
 		 507 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.37 
 
 		 503 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 540 aa  359  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 494 aa  359  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  43.36 
 
 		 492 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  38.21 
 
 		 496 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 		 509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.39 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 		 492 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.18 
 
 		 501 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.97 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.4 
 
 		 503 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>