More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4637 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  100 
 
 		 539 aa  1062    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  70.64 
 
 		 521 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  68.26 
 
 		 555 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  59.06 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  57.76 
 
 		 537 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  58.1 
 
 		 517 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  57.91 
 
 		 524 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  57.71 
 
 		 517 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  56.92 
 
 		 517 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  56.03 
 
 		 517 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  55.84 
 
 		 517 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  56.72 
 
 		 517 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  55.68 
 
 		 532 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 		 537 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  57.81 
 
 		 537 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  57.61 
 
 		 537 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  55.62 
 
 		 520 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  57.49 
 
 		 537 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  57.61 
 
 		 537 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  58.01 
 
 		 534 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  57.29 
 
 		 537 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  55.45 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 		 515 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  56.73 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  55.41 
 
 		 548 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  55.86 
 
 		 523 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  55.12 
 
 		 526 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  54.7 
 
 		 523 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 523 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  54.42 
 
 		 526 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  56.34 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  46.61 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.6 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  43.87 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.29 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.98 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.31 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.29 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.49 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 497 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  42.12 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  45.21 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  41.8 
 
 		 505 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  42.57 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.63 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.63 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.2 
 
 		 516 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.63 
 
 		 514 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  43.45 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.78 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.14 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 499 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  43.39 
 
 		 497 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 		 540 aa  360  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  40.95 
 
 		 499 aa  360  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0768  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 496 aa  359  6e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000105666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  37.4 
 
 		 500 aa  359  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.44 
 
 		 503 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.48 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  42.69 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  42.46 
 
 		 513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 		 522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 		 499 aa  357  3.9999999999999996e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  43.2 
 
 		 495 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.93 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.25 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  42.33 
 
 		 514 aa  355  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 		 515 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  41.18 
 
 		 512 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.8 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  41.18 
 
 		 512 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 		 515 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 		 515 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 525 aa  352  8e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  37.73 
 
 		 506 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 		 511 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.89 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.56 
 
 		 861 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2078  ABC transporter related  43.85 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529914 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 525 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  40.35 
 
 		 500 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.86 
 
 		 514 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.76 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.26 
 
 		 512 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 498 aa  350  3e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.01 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 494 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.48 
 
 		 494 aa  349  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 520 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.34 
 
 		 513 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 		 494 aa  349  8e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 494 aa  349  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 494 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38 
 
 		 496 aa  349  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  42.91 
 
 		 526 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>