More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1016 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1026    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  80.99 
 
 		 526 aa  831    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  80.61 
 
 		 526 aa  828    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  61.71 
 
 		 537 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  60.04 
 
 		 517 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  62.25 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  63.58 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  62.65 
 
 		 517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  62.45 
 
 		 524 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  60.47 
 
 		 517 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  62.45 
 
 		 517 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  59.24 
 
 		 517 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  60.48 
 
 		 520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  62.4 
 
 		 515 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  61.79 
 
 		 537 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  61.31 
 
 		 532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  61.23 
 
 		 536 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  62.83 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  61.79 
 
 		 537 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  61.79 
 
 		 537 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  59.43 
 
 		 532 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  62.47 
 
 		 537 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  61.59 
 
 		 537 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  62.58 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  61.59 
 
 		 537 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  62.4 
 
 		 548 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  62.2 
 
 		 523 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  62.4 
 
 		 523 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  56.35 
 
 		 521 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  55.51 
 
 		 539 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  52.66 
 
 		 555 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  48.3 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.2 
 
 		 516 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.45 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.89 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.89 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.89 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.05 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.36 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  48.34 
 
 		 512 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.35 
 
 		 517 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  46.11 
 
 		 513 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.33 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.36 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  44.29 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.69 
 
 		 520 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.42 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.08 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  45.51 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.28 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.11 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  46.58 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.48 
 
 		 513 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  44.88 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  46.51 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  45.08 
 
 		 492 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.59 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  41.72 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  43.65 
 
 		 512 aa  379  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.36 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  43.51 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.89 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  43 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  46.17 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  43.04 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  43.04 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.29 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.44 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.71 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.73 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.93 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.64 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 		 508 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  43.33 
 
 		 505 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.43 
 
 		 500 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 509 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.52 
 
 		 519 aa  363  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.73 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  39.73 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  43.69 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  35.74 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  40.08 
 
 		 525 aa  361  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3274  ABC transporter related  44.21 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 		 507 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.85 
 
 		 504 aa  360  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 499 aa  359  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.09 
 
 		 517 aa  359  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4553  D-allose transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 510 aa  359  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>