More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0946 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  80.61 
 
 		 523 aa  828    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  100 
 
 		 526 aa  1041    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  98.1 
 
 		 526 aa  1020    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  61.49 
 
 		 537 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  60.19 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  61.61 
 
 		 536 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  62.01 
 
 		 515 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  61.35 
 
 		 537 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  61.35 
 
 		 537 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  59.43 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  61.35 
 
 		 537 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  61.13 
 
 		 517 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  61.52 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  61.72 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  61.36 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  60.96 
 
 		 537 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  60.96 
 
 		 537 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 524 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  61.16 
 
 		 537 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  61.6 
 
 		 534 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  60.23 
 
 		 532 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  60.27 
 
 		 532 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  61.81 
 
 		 548 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  60.28 
 
 		 520 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  61.61 
 
 		 523 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  61.81 
 
 		 523 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  61.58 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  60.4 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  56.32 
 
 		 521 aa  528  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  54.53 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  51.83 
 
 		 555 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 		 512 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.01 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.02 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.6 
 
 		 520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46 
 
 		 515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  47.39 
 
 		 513 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.59 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  47.19 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.91 
 
 		 516 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.18 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.18 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.9 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  47.02 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.69 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.69 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.61 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.71 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  46.63 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  46.69 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  43.89 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  44.55 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.12 
 
 		 497 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.51 
 
 		 513 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  45.2 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  46.2 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  43.18 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  44.95 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.8 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42.14 
 
 		 524 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  44.74 
 
 		 492 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  41.24 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.95 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.84 
 
 		 501 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.57 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  40.16 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  44.51 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.55 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  45.03 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.96 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.75 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  45.58 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40.96 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.57 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  42.83 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  40.12 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.99 
 
 		 540 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  41.96 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  41.37 
 
 		 502 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 492 aa  363  3e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.35 
 
 		 525 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.85 
 
 		 519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  42.51 
 
 		 497 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.44 
 
 		 499 aa  362  8e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  42.09 
 
 		 513 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.71 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.74 
 
 		 519 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.92 
 
 		 517 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.7 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>