More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1584 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  80.12 
 
 		 520 aa  761    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  71.65 
 
 		 524 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  71.74 
 
 		 510 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 517 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  71.72 
 
 		 517 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  91.06 
 
 		 537 aa  934    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  74.33 
 
 		 548 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  74.65 
 
 		 517 aa  728    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  94.6 
 
 		 537 aa  970    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  76.79 
 
 		 515 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  79.54 
 
 		 532 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  72.11 
 
 		 517 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  78.29 
 
 		 536 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  76.42 
 
 		 537 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  100 
 
 		 537 aa  1056    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  72.71 
 
 		 517 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  99.26 
 
 		 537 aa  1050    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  78.74 
 
 		 532 aa  778    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  90.88 
 
 		 537 aa  933    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  71.26 
 
 		 510 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  99.26 
 
 		 537 aa  1050    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  72.71 
 
 		 517 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  89.03 
 
 		 534 aa  900    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  74.76 
 
 		 523 aa  727    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  74.76 
 
 		 523 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  61.48 
 
 		 526 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  60.88 
 
 		 526 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  60.69 
 
 		 523 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  55.95 
 
 		 539 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  57.75 
 
 		 521 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  54.17 
 
 		 555 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  45.07 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.87 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.04 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.59 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.28 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.95 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.97 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.97 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  47.45 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  45.59 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.75 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.18 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.6 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.78 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.18 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.75 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.16 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.63 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.18 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.4 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 511 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 497 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  44.25 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.31 
 
 		 513 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  43.86 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  46.23 
 
 		 508 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.65 
 
 		 508 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.42 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42.12 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  45.75 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  43.66 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  41.58 
 
 		 495 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.67 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.32 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.32 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.98 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  42.32 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  42.32 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.42 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.67 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.68 
 
 		 540 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.92 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  37.79 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.98 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.56 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  45.49 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  42.53 
 
 		 505 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  44.13 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0768  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000105666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>