More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4746 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1236  ABC transporter related  79.32 
 
 
520 aa  750    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154748  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  71.34 
 
 
510 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 
524 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  72.75 
 
 
517 aa  720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  71.74 
 
 
517 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2020  ABC transporter, ATP-binding protein  75.96 
 
 
548 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1920  ABC transporter-like  73.75 
 
 
517 aa  723    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1630  ABC transporter related  89.22 
 
 
534 aa  907    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4746  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 
537 aa  1053    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16753  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  77.99 
 
 
532 aa  772    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  73.31 
 
 
517 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  72.51 
 
 
517 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1584  ABC transporter related  94.6 
 
 
537 aa  970    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133672  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2474  D-xylose ABC transporter, ATP-binding protein  77.45 
 
 
515 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  76.2 
 
 
537 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  78.99 
 
 
532 aa  770    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  77.12 
 
 
536 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  73.11 
 
 
517 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1127  ABC transporter related  94.23 
 
 
537 aa  968    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.071444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1504  ABC transporter related  89.39 
 
 
537 aa  919    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.170489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39330  ribose transporter  71.46 
 
 
510 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.683009  normal  0.485398 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1607  ABC transporter related  94.23 
 
 
537 aa  968    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1523  ABC transporter related  89.57 
 
 
537 aa  923    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686144  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1855  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.96 
 
 
523 aa  730    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1868  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.96 
 
 
523 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  60.91 
 
 
526 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0946  ABC transporter related  61.69 
 
 
526 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516195  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 
523 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4637  ABC transporter related  55.76 
 
 
539 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  57.95 
 
 
521 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2132  ABC transporter related  53.64 
 
 
555 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  44.27 
 
 
501 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  46.46 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.76 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  47.24 
 
 
495 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.63 
 
 
513 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.22 
 
 
515 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
512 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.23 
 
 
517 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.67 
 
 
514 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.67 
 
 
516 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  45.84 
 
 
511 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  44.87 
 
 
511 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.97 
 
 
512 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.69 
 
 
514 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.09 
 
 
520 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.97 
 
 
512 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.69 
 
 
514 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.77 
 
 
514 aa  385  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  44.25 
 
 
512 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.85 
 
 
512 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.68 
 
 
499 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.36 
 
 
513 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 
540 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.25 
 
 
507 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.87 
 
 
514 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.14 
 
 
497 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 
508 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.4 
 
 
519 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
501 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.85 
 
 
508 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  44.47 
 
 
506 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  45.17 
 
 
505 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.52 
 
 
496 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 
508 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
511 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 
501 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  45.97 
 
 
509 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.17 
 
 
504 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  43.18 
 
 
499 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
504 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  43.18 
 
 
499 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 
507 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
523 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
504 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  0.000000120675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.38 
 
 
504 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
504 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000458478 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
523 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
504 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.71 
 
 
513 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
504 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.65 
 
 
506 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  42.17 
 
 
504 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
523 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
504 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40.36 
 
 
496 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  41.58 
 
 
495 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.22 
 
 
503 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.38 
 
 
494 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.31 
 
 
504 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  45.29 
 
 
492 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
497 aa  370  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.38 
 
 
524 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.73 
 
 
507 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
492 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
507 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>