More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4598 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  94.58 
 
 
511 aa  952    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  100 
 
 
506 aa  1018    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  59.51 
 
 
501 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  47.42 
 
 
515 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.88 
 
 
514 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.88 
 
 
514 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  47.54 
 
 
517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.88 
 
 
514 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  47.47 
 
 
516 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.8 
 
 
513 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.33 
 
 
513 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 
512 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.2 
 
 
512 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.18 
 
 
514 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  45.64 
 
 
495 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  46.71 
 
 
508 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.18 
 
 
512 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.77 
 
 
520 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.18 
 
 
512 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  45.04 
 
 
512 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.26 
 
 
499 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  43.97 
 
 
494 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 
501 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.95 
 
 
504 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.77 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  43.66 
 
 
503 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 
507 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.89 
 
 
514 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  46.89 
 
 
502 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  45.85 
 
 
509 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  43.69 
 
 
501 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.54 
 
 
499 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.23 
 
 
495 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 
507 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.1 
 
 
503 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.7 
 
 
524 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  45.85 
 
 
520 aa  412  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.61 
 
 
503 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.89 
 
 
494 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.2 
 
 
507 aa  412  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.54 
 
 
499 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.75 
 
 
501 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  44.35 
 
 
508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2368  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.696414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  44.55 
 
 
517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.62 
 
 
527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.62 
 
 
524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.5 
 
 
524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.01 
 
 
495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 
502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.41 
 
 
524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  44.49 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.62 
 
 
524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  42.54 
 
 
509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.27 
 
 
508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  41.19 
 
 
504 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.38 
 
 
512 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  44.35 
 
 
499 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  42.44 
 
 
516 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.06 
 
 
513 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  42.44 
 
 
516 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.13 
 
 
524 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.42 
 
 
504 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  44.44 
 
 
499 aa  405  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  41.06 
 
 
500 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  42.44 
 
 
516 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42.54 
 
 
524 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
499 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.67 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
528 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  42.19 
 
 
521 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  41.67 
 
 
506 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.18 
 
 
497 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  43.03 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  42.94 
 
 
506 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  45.62 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  43.61 
 
 
503 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  44.17 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  42.52 
 
 
516 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  44 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  41.27 
 
 
501 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  41.27 
 
 
501 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 
496 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 
506 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 
506 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
506 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  41.18 
 
 
513 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  42.21 
 
 
506 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 
515 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.56 
 
 
515 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
506 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  45.14 
 
 
497 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.18 
 
 
516 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
506 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  41.27 
 
 
501 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  42.03 
 
 
501 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 
502 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 
494 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>