More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2398 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2398  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 509 aa  1016    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.64453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  60.12 
 
 		 492 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2036  ABC transporter related  59.51 
 
 		 492 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  59.8 
 
 		 495 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.97 
 
 		 492 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 		 523 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.13 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.4 
 
 		 513 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  43.78 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  44.38 
 
 		 525 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  43.99 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  42.51 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.54 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.8 
 
 		 514 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.97 
 
 		 540 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.66 
 
 		 516 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.6 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.74 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.9 
 
 		 514 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.06 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  42.07 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1998  ABC ribose transporter, fused ATPase subunits  44.77 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0790932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0574  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.9 
 
 		 536 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.7 
 
 		 514 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.71 
 
 		 524 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.7 
 
 		 514 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.88 
 
 		 512 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.28 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.72 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  42.25 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  42.25 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  42.28 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  42.25 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4158  ABC transporter related  44.42 
 
 		 537 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.605809 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.06 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  42.25 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.07 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  42.48 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  42.07 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  42.42 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 		 496 aa  369  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.5 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2262  ABC transporter related  44.58 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  44.47 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.07 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  43.53 
 
 		 512 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.16 
 
 		 516 aa  369  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.45 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  43.7 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  40.72 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.96 
 
 		 520 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  40 
 
 		 518 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  42.21 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  42.25 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 		 523 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  41.1 
 
 		 505 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.02 
 
 		 515 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 499 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  42.48 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  42.45 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  40.99 
 
 		 513 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.7 
 
 		 525 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  42.71 
 
 		 522 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  40.43 
 
 		 513 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  41.47 
 
 		 504 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.25 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.12 
 
 		 520 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0881  ABC transporter related  44.38 
 
 		 526 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218523  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  42.68 
 
 		 501 aa  362  9e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 496 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  42.16 
 
 		 496 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4197  ABC transporter-related protein  43.26 
 
 		 521 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.8 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  43.68 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>