More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2338 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2338  ABC transporter-like  100 
 
 		 518 aa  1011    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4830  ABC transporter related  45.27 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5888  ABC transporter related  46.18 
 
 		 518 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.342287  normal  0.513362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0519  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  43.3 
 
 		 498 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  47.13 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0405  ABC transporter related  42.34 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6179  ABC transporter related  44.08 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.230595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1258  ABC transporter related  43.69 
 
 		 520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6574  ABC transporter related  43.69 
 
 		 520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.108147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6147  ABC transporter related  45.15 
 
 		 493 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0846704  hitchhiker  0.00350448 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6562  ABC transporter related  45.59 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal  0.460133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.31 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.62 
 
 		 519 aa  340  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.59 
 
 		 861 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  39.84 
 
 		 500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  38.76 
 
 		 528 aa  327  4.0000000000000003e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  37.92 
 
 		 537 aa  327  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  40.2 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  39.14 
 
 		 506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.2 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39.96 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  36.95 
 
 		 510 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  34.82 
 
 		 498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.86 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.6 
 
 		 518 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  40.33 
 
 		 522 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  36.44 
 
 		 515 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  35.74 
 
 		 499 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 492 aa  309  9e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  35.54 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  35.54 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  35.33 
 
 		 495 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  37.73 
 
 		 501 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  39.92 
 
 		 503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  40.66 
 
 		 519 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  39.26 
 
 		 517 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  39.26 
 
 		 517 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  35.44 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5197  ABC transporter related  39.05 
 
 		 540 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.15 
 
 		 506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  37.78 
 
 		 497 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.88 
 
 		 506 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 516 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1398  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.31 
 
 		 539 aa  302  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00538368  normal  0.128237 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 517 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 521 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  39 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  38.2 
 
 		 519 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  39 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  39 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  38.88 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.51 
 
 		 498 aa  301  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.05 
 
 		 508 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  36.96 
 
 		 506 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.51 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.13 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  34.83 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 511 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  37.77 
 
 		 517 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  34.74 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  33.94 
 
 		 499 aa  300  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  33.78 
 
 		 504 aa  299  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 		 517 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.88 
 
 		 492 aa  299  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  34.19 
 
 		 501 aa  299  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  36.69 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  36.65 
 
 		 518 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 541 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 500 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 500 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  32.93 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  36.49 
 
 		 507 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  34.53 
 
 		 516 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  39.92 
 
 		 522 aa  297  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 505 aa  297  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  37.16 
 
 		 500 aa  297  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  36.69 
 
 		 497 aa  297  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3093  ABC transporter related  38.15 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.193565  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  36.98 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  33.67 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  33.82 
 
 		 494 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 		 507 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  34.39 
 
 		 501 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 		 506 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  37.23 
 
 		 504 aa  296  9e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  35.33 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  39.67 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  37.7 
 
 		 518 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  37.29 
 
 		 513 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.85 
 
 		 512 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  34.52 
 
 		 510 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  35.8 
 
 		 511 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  36.29 
 
 		 503 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  36.71 
 
 		 505 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>