More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7832 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1398  ABC sugar transporter, ATPase subunit  65.78 
 
 		 539 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00538368  normal  0.128237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 541 aa  1070    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5197  ABC transporter related  66.16 
 
 		 540 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  42.45 
 
 		 499 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 497 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  43.35 
 
 		 502 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.14 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.95 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  44.86 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  44.77 
 
 		 521 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.97 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  41.94 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.65 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.83 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.91 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  40.9 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.66 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  43.52 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.9 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  41.97 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  40.75 
 
 		 513 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  45.64 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  43.85 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  39.43 
 
 		 505 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  44.58 
 
 		 500 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.29 
 
 		 512 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.95 
 
 		 503 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  39.2 
 
 		 495 aa  362  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  42.97 
 
 		 495 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.76 
 
 		 524 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  42.5 
 
 		 508 aa  362  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.37 
 
 		 513 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  42.89 
 
 		 524 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.76 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  42.21 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  39.41 
 
 		 503 aa  360  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  42.25 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  36.53 
 
 		 500 aa  360  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  39.22 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  41.3 
 
 		 506 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.54 
 
 		 494 aa  359  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 		 494 aa  359  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 		 494 aa  359  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  40.96 
 
 		 528 aa  359  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 504 aa  358  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  37.5 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1397  ABC transporter related  43.43 
 
 		 492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0472986  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  38.28 
 
 		 495 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  42.28 
 
 		 526 aa  358  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  44.58 
 
 		 502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.42 
 
 		 514 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  37.5 
 
 		 500 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.79 
 
 		 513 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  37.5 
 
 		 499 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.65 
 
 		 509 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 494 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  44.82 
 
 		 509 aa  356  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 494 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  41.19 
 
 		 512 aa  355  7.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 501 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.06 
 
 		 509 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  41.27 
 
 		 512 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  41.27 
 
 		 512 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  40.04 
 
 		 525 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  37.5 
 
 		 499 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38.88 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  40.62 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 525 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.7 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.2 
 
 		 506 aa  355  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  38.43 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.67 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  38.67 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  39.45 
 
 		 520 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 513 aa  353  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40 
 
 		 504 aa  352  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  40.76 
 
 		 526 aa  352  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  41.16 
 
 		 511 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39 
 
 		 506 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.37 
 
 		 506 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.99 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.52 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  43.06 
 
 		 498 aa  352  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>